RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637353.1

EFHC1-233, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5 BASIC

Gene EFHC1, Length 3,829 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-233	ENST00000637353	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
EFHC1-233	ENST00000637353	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
EFHC1-233	ENST00000637353	FBLN2	P98095	1184 aa		11.76	□□□□□ -0.53
EFHC1-233	ENST00000637353	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
EFHC1-233	ENST00000637353	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
EFHC1-233	ENST00000637353	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-233	ENST00000637353	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-233	ENST00000637353	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-233	ENST00000637353	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		11.71	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	IGF1R	P08069	1367 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		11.67	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	CUL7	Q14999	1698 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	P3H3	Q8IVL6	736 aa		11.65	□□□□□ -0.54
EFHC1-233	ENST00000637353	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.65	□□□□□ -0.55
EFHC1-233	ENST00000637353	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-233	ENST00000637353	CLIP1	P30622	1438 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EFHC1-233	ENST00000637353	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EFHC1-233	ENST00000637353	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.6	□□□□□ -0.55
EFHC1-233	ENST00000637353	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.59	□□□□□ -0.55
EFHC1-233	ENST00000637353	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.58	□□□□□ -0.56
EFHC1-233	ENST00000637353	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
EFHC1-233	ENST00000637353	KIF21B	O75037	1637 aa		11.54	□□□□□ -0.56
EFHC1-233	ENST00000637353	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
EFHC1-233	ENST00000637353	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.52	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	NUP160	Q12769	1436 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		11.51	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	JPH4	Q96JJ6	628 aa		11.5	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.49	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	CHD1	O14646	1710 aa		11.49	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	FKBP8	Q14318	412 aa		11.47	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
EFHC1-233	ENST00000637353	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.46	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	IQGAP2	Q13576	1575 aa		11.45	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.44	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.43	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	MYT1	Q01538	1121 aa		11.4	□□□□□ -0.58
EFHC1-233	ENST00000637353	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.4	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.39	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		11.38	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		11.38	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.38	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	PTPRG	P23470	1445 aa		11.37	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.34	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.34	□□□□□ -0.59
EFHC1-233	ENST00000637353	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		11.32	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	NEFL	P07196	543 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.31	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	KIAA0556	O60303	1618 aa		11.29	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	DISP1	Q96F81	1524 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.28	□□□□□ -0.6
EFHC1-233	ENST00000637353	UACA	Q9BZF9	1416 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.26	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.24	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.23	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
EFHC1-233	ENST00000637353	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	ANP32C	O43423	234 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	ABCC2	Q92887	1545 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFHC1-233	ENST00000637353	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.15	□□□□□ -0.63
EFHC1-233	ENST00000637353	ABCA8	O94911	1581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFHC1-233	ENST00000637353	FOXD1	Q16676	465 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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