RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597330.1

LETM1P2-201, Transcript of leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene LETM1P2, Length 2,178 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1P2-201ENST00000597330 CUX2O14529 1486 aa26.6■■□□□ 1.85
LETM1P2-201ENST00000597330 KIF27Q86VH2 1401 aa26.59■■□□□ 1.85
LETM1P2-201ENST00000597330 BCANQ96GW7 911 aa26.58■■□□□ 1.85
LETM1P2-201ENST00000597330 FKBP8Q14318 412 aa26.56■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.55■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.53■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 APLP2Q06481 763 aa26.53■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 MSH5O43196 834 aa26.5■■□□□ 1.83
LETM1P2-201ENST00000597330 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
LETM1P2-201ENST00000597330 WDR97A6NE52 1622 aa26.48■■□□□ 1.83
LETM1P2-201ENST00000597330 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.47■■□□□ 1.83
LETM1P2-201ENST00000597330 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.43■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 IFT140Q96RY7 1462 aa26.43■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 NEFLP07196 543 aa26.41■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 IGF1RP08069 1367 aa26.39■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.39■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 KCNH8Q96L42 1107 aa26.36■■□□□ 1.81
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.36■■□□□ 1.81
LETM1P2-201ENST00000597330 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.34■■□□□ 1.81
LETM1P2-201ENST00000597330 PRXQ9BXM0 1461 aa26.32■■□□□ 1.8
LETM1P2-201ENST00000597330 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
LETM1P2-201ENST00000597330 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
LETM1P2-201ENST00000597330 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.26■■□□□ 1.79
LETM1P2-201ENST00000597330 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.24■■□□□ 1.79
LETM1P2-201ENST00000597330 PBRM1Q86U86 1689 aa26.21■■□□□ 1.79
LETM1P2-201ENST00000597330 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 ITGAEP38570 1179 aa26.2■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 CUL7Q14999 1698 aa26.19■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 GRIN2BQ13224 1484 aa26.18■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 ARAP1Q96P48 1450 aa26.12■■□□□ 1.77
LETM1P2-201ENST00000597330 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
LETM1P2-201ENST00000597330 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
LETM1P2-201ENST00000597330 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 CCER2I3L3R5 266 aa26.07■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.05■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.05■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 ADAMTS12P58397 1594 aa26.04■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26■■□□□ 1.75
LETM1P2-201ENST00000597330 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
LETM1P2-201ENST00000597330 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 MAPKBP1O60336 1514 aa25.94■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 TRIM52Q96A61 297 aa25.94■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.92■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 SYNJ2O15056 1496 aa25.89■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 FBLN2P98095 1184 aa25.87■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.87■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 GRIN2AQ12879 1464 aa25.85■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 ANP32CO43423 234 aa25.84■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.81■■□□□ 1.72
LETM1P2-201ENST00000597330 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 MAP3K1Q13233 1512 aa25.75■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.74■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.72■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 IQGAP2Q13576 1575 aa25.7■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 CEP170Q5SW79 1584 aa25.7■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 CHD1O14646 1710 aa25.69■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.69■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.68■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 NUP160Q12769 1436 aa25.67■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 TIAM1Q13009 1591 aa25.66■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.66■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 P3H3Q8IVL6 736 aa25.65■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
LETM1P2-201ENST00000597330 NBR1Q14596 966 aa25.63■■□□□ 1.69
LETM1P2-201ENST00000597330 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.63■■□□□ 1.69
LETM1P2-201ENST00000597330 SAMD9Q5K651 1589 aa25.58■■□□□ 1.69
LETM1P2-201ENST00000597330 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.56■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.56■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.56■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.56■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 JPH4Q96JJ6 628 aa25.5■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.5■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.48■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 IL27Q8NEV9 243 aa25.46■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 DISP1Q96F81 1524 aa25.46■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.44■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.44■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 KIAA0556O60303 1618 aa25.44■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 FMN1Q68DA7 1419 aa25.42■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.41■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.39■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.38■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.38■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.4 ms