RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570174.1

LONP2-209, Transcript of lon peptidase 2, peroxisomal, human

TSL 5

Gene LONP2, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LONP2-209	ENST00000570174	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LONP2-209	ENST00000570174	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LONP2-209	ENST00000570174	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LONP2-209	ENST00000570174	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LONP2-209	ENST00000570174	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LONP2-209	ENST00000570174	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LONP2-209	ENST00000570174	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LONP2-209	ENST00000570174	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LONP2-209	ENST00000570174	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.06	□□□□□ -0.64
LONP2-209	ENST00000570174	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
LONP2-209	ENST00000570174		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
LONP2-209	ENST00000570174	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.01	□□□□□ -0.65
LONP2-209	ENST00000570174	SYNJ1	O43426	1573 aa		11	□□□□□ -0.65
LONP2-209	ENST00000570174	TOP2B	Q02880	1626 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LONP2-209	ENST00000570174	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LONP2-209	ENST00000570174	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LONP2-209	ENST00000570174	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LONP2-209	ENST00000570174	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
LONP2-209	ENST00000570174	GRIN2A	Q12879	1464 aa		10.95	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	JPH4	Q96JJ6	628 aa		10.95	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		10.94	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		10.94	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	ARAP1	Q96P48	1450 aa		10.94	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	KIF27	Q86VH2	1401 aa		10.94	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	NUP160	Q12769	1436 aa		10.93	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	IGF1R	P08069	1367 aa		10.93	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		10.93	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	APLP2	Q06481	763 aa		10.92	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		10.91	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	CHD1	O14646	1710 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
LONP2-209	ENST00000570174	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	10.87	□□□□□ -0.67
LONP2-209	ENST00000570174	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LONP2-209	ENST00000570174	ADAMTS12	P58397	1594 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LONP2-209	ENST00000570174	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
LONP2-209	ENST00000570174	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LONP2-209	ENST00000570174	PBRM1	Q86U86	1689 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LONP2-209	ENST00000570174	CEP170	Q5SW79	1584 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LONP2-209	ENST00000570174	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LONP2-209	ENST00000570174	RNF39	Q9H2S5	420 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LONP2-209	ENST00000570174	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		10.77	□□□□□ -0.68
LONP2-209	ENST00000570174	PTPRG	P23470	1445 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LONP2-209	ENST00000570174	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
LONP2-209	ENST00000570174	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LONP2-209	ENST00000570174	SHROOM2	Q13796	1616 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LONP2-209	ENST00000570174	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LONP2-209	ENST00000570174	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		10.72	□□□□□ -0.69
LONP2-209	ENST00000570174	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		10.72	□□□□□ -0.69
LONP2-209	ENST00000570174	CUL7	Q14999	1698 aa		10.72	□□□□□ -0.69
LONP2-209	ENST00000570174	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
LONP2-209	ENST00000570174	FKBP8	Q14318	412 aa		10.69	□□□□□ -0.7
LONP2-209	ENST00000570174	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.68	□□□□□ -0.7
LONP2-209	ENST00000570174	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
LONP2-209	ENST00000570174	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	UACA	Q9BZF9	1416 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	EEA1	Q15075	1411 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	PRX	Q9BXM0	1461 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	MAPKBP1	O60336	1514 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	GOLGA3	Q08378	1498 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	IQGAP2	Q13576	1575 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		10.61	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	ABCC2	Q92887	1545 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		10.6	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	DISP1	Q96F81	1524 aa		10.59	□□□□□ -0.71
LONP2-209	ENST00000570174	ASXL2	Q76L83	1435 aa		10.56	□□□□□ -0.72
LONP2-209	ENST00000570174	CAPN15	O75808	1086 aa		10.55	□□□□□ -0.72
LONP2-209	ENST00000570174	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.54	□□□□□ -0.72
LONP2-209	ENST00000570174	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		10.53	□□□□□ -0.72
LONP2-209	ENST00000570174	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.51	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	KCNH8	Q96L42	1107 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	POLA2	Q14181	598 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	DIP2B	Q9P265	1576 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	KIAA0556	O60303	1618 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	GLI2	P10070	1586 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LONP2-209	ENST00000570174	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	CD109	Q6YHK3	1445 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	ABCA8	O94911	1581 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	ATP10B	O94823	1461 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	ARID3C	A6NKF2	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LONP2-209	ENST00000570174	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
LONP2-209	ENST00000570174	KDM6B	O15054	1643 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LONP2-209	ENST00000570174	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LONP2-209	ENST00000570174	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LONP2-209	ENST00000570174	FMN1	Q68DA7	1419 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LONP2-209	ENST00000570174	PROM2	Q8N271	834 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LONP2-209	ENST00000570174	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		10.36	□□□□□ -0.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms