RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
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RD3L-201ENST00000557640 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.84■□□□□ 0.13
RD3L-201ENST00000557640 GABBR2O75899 941 aa15.79■□□□□ 0.12
RD3L-201ENST00000557640 WDR62O43379 1518 aa15.78■□□□□ 0.12
RD3L-201ENST00000557640 CHADLQ6NUI6 762 aa15.78■□□□□ 0.12
RD3L-201ENST00000557640 WIZO95785 1651 aa15.78■□□□□ 0.12
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RD3L-201ENST00000557640 PRR29P0C7W0 189 aa15.72■□□□□ 0.11
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RD3L-201ENST00000557640 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.63■□□□□ 0.09
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RD3L-201ENST00000557640 PRDM2Q13029 1718 aa15.55■□□□□ 0.08
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RD3L-201ENST00000557640 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.46■□□□□ 0.07
RD3L-201ENST00000557640 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.46■□□□□ 0.07
RD3L-201ENST00000557640 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RD3L-201ENST00000557640 POTEIP0CG38 1075 aa15.41■□□□□ 0.06
RD3L-201ENST00000557640 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
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RD3L-201ENST00000557640 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.33■□□□□ 0.04
RD3L-201ENST00000557640 CHD1O14646 1710 aa15.33■□□□□ 0.04
RD3L-201ENST00000557640 TOPBP1Q92547 1522 aa15.3■□□□□ 0.04
RD3L-201ENST00000557640 IFT140Q96RY7 1462 aa15.29■□□□□ 0.04
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RD3L-201ENST00000557640 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RD3L-201ENST00000557640 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
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RD3L-201ENST00000557640 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
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RD3L-201ENST00000557640 GRIN2BQ13224 1484 aa14.89□□□□□ -0.03
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RD3L-201ENST00000557640 ADAMTS12P58397 1594 aa14.81□□□□□ -0.04
RD3L-201ENST00000557640 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.8□□□□□ -0.04
RD3L-201ENST00000557640 CEP170Q5SW79 1584 aa14.8□□□□□ -0.04
RD3L-201ENST00000557640 POTEMA6NI47 508 aa14.78□□□□□ -0.04
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RD3L-201ENST00000557640 GRIN2AQ12879 1464 aa14.74□□□□□ -0.05
RD3L-201ENST00000557640 POTEGQ6S5H5 508 aa14.73□□□□□ -0.05
RD3L-201ENST00000557640 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.73□□□□□ -0.05
RD3L-201ENST00000557640 METRNQ9UJH8 293 aa14.73□□□□□ -0.05
RD3L-201ENST00000557640 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.73□□□□□ -0.05
RD3L-201ENST00000557640 NUP160Q12769 1436 aa14.71□□□□□ -0.05
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RD3L-201ENST00000557640 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.62□□□□□ -0.07
RD3L-201ENST00000557640 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.62□□□□□ -0.07
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RD3L-201ENST00000557640 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.58□□□□□ -0.07
RD3L-201ENST00000557640 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
RD3L-201ENST00000557640 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.56□□□□□ -0.08
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