RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550047.5

SLC8B1-210, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC8B1, Length 2,493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-210ENST00000550047 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC8B1-210ENST00000550047 WDR97A6NE52 1622 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC8B1-210ENST00000550047 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1-210ENST00000550047 BCANQ96GW7 911 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC8B1-210ENST00000550047 FKBP8Q14318 412 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC8B1-210ENST00000550047 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1-210ENST00000550047 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC8B1-210ENST00000550047 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC8B1-210ENST00000550047 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1-210ENST00000550047 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SLC8B1-210ENST00000550047 IGF1RP08069 1367 aa24.14■■□□□ 1.45
SLC8B1-210ENST00000550047 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC8B1-210ENST00000550047 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SLC8B1-210ENST00000550047 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC8B1-210ENST00000550047 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC8B1-210ENST00000550047 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC8B1-210ENST00000550047 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC8B1-210ENST00000550047 CCER2I3L3R5 266 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC8B1-210ENST00000550047 NEFLP07196 543 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC8B1-210ENST00000550047 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC8B1-210ENST00000550047 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC8B1-210ENST00000550047 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SLC8B1-210ENST00000550047 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SLC8B1-210ENST00000550047 ANP32CO43423 234 aa24.01■■□□□ 1.43
SLC8B1-210ENST00000550047 TRIM52Q96A61 297 aa24■■□□□ 1.43
SLC8B1-210ENST00000550047 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SLC8B1-210ENST00000550047 TOPBP1Q92547 1522 aa23.97■■□□□ 1.43
SLC8B1-210ENST00000550047 NESP48681 1621 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC8B1-210ENST00000550047 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.95■■□□□ 1.42
SLC8B1-210ENST00000550047 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
SLC8B1-210ENST00000550047 P3H3Q8IVL6 736 aa23.91■■□□□ 1.42
SLC8B1-210ENST00000550047 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SLC8B1-210ENST00000550047 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SLC8B1-210ENST00000550047 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.88■■□□□ 1.41
SLC8B1-210ENST00000550047 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.87■■□□□ 1.41
SLC8B1-210ENST00000550047 TONSLQ96HA7 1378 aa23.86■■□□□ 1.41
SLC8B1-210ENST00000550047 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.85■■□□□ 1.41
SLC8B1-210ENST00000550047 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.82■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 BCL11AQ9H165 835 aa23.82■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.8■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.8■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.8■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 CUL7Q14999 1698 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC8B1-210ENST00000550047 UACAQ9BZF9 1416 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC8B1-210ENST00000550047 HFM1A2PYH4 1435 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC8B1-210ENST00000550047 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC8B1-210ENST00000550047 PTPRKQ15262 1439 aa23.71■■□□□ 1.39
SLC8B1-210ENST00000550047 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.69■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.68■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 MSH5O43196 834 aa23.68■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.68■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.67■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 FMN1Q68DA7 1419 aa23.67■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.66■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 NAIPQ13075 1403 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC8B1-210ENST00000550047 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC8B1-210ENST00000550047 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SLC8B1-210ENST00000550047 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SLC8B1-210ENST00000550047 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC8B1-210ENST00000550047 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SLC8B1-210ENST00000550047 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.58■■□□□ 1.36
SLC8B1-210ENST00000550047 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.58■■□□□ 1.36
SLC8B1-210ENST00000550047 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC8B1-210ENST00000550047 NCOA2Q15596 1464 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC8B1-210ENST00000550047 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SLC8B1-210ENST00000550047 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.53■■□□□ 1.36
SLC8B1-210ENST00000550047 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SLC8B1-210ENST00000550047 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.52■■□□□ 1.36
SLC8B1-210ENST00000550047 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 SAMD9Q5K651 1589 aa23.5■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 GRIN2BQ13224 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.47■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 HECW1Q76N89 1606 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC8B1-210ENST00000550047 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC8B1-210ENST00000550047 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SLC8B1-210ENST00000550047 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC8B1-210ENST00000550047 CCDC184Q52MB2 194 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC8B1-210ENST00000550047 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.43■■□□□ 1.34
SLC8B1-210ENST00000550047 ARHGEF11O15085 1522 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC8B1-210ENST00000550047 PBRM1Q86U86 1689 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC8B1-210ENST00000550047 WDR62O43379 1518 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC8B1-210ENST00000550047 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SLC8B1-210ENST00000550047 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC8B1-210ENST00000550047 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SLC8B1-210ENST00000550047 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC8B1-210ENST00000550047 NCOA1Q15788 1441 aa23.36■■□□□ 1.33
SLC8B1-210ENST00000550047 KDM6BO15054 1643 aa23.36■■□□□ 1.33
SLC8B1-210ENST00000550047 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.35■■□□□ 1.33
SLC8B1-210ENST00000550047 IFT140Q96RY7 1462 aa23.35■■□□□ 1.33
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