RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 PRDM2Q13029 1718 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 TOP2BQ02880 1626 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 EEA1Q15075 1411 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 IGF1RP08069 1367 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 PTPRGP23470 1445 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 GRIN2AQ12879 1464 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRB-206ENST00000548122 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA3Q08378 1498 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRB-206ENST00000548122 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 WDR97A6NE52 1622 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF11O15085 1522 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-206ENST00000548122 ADAMTS12P58397 1594 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 CHD1O14646 1710 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 PBRM1Q86U86 1689 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 CUL7Q14999 1698 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 CLIP1P30622 1438 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 NUP160Q12769 1436 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 IQGAP2Q13576 1575 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-206ENST00000548122 ITGAEP38570 1179 aa8.34□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 UACAQ9BZF9 1416 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 FMN1Q68DA7 1419 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 HRCP23327 699 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 CEP170Q5SW79 1584 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 ARAP1Q96P48 1450 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 PRXQ9BXM0 1461 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 MLECQ14165 292 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-206ENST00000548122 CEP162Q5TB80 1403 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-206ENST00000548122 TSPY4P0CV99 314 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRB-206ENST00000548122 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-206ENST00000548122 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-206ENST00000548122 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRB-206ENST00000548122 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-206ENST00000548122 CD109Q6YHK3 1445 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-206ENST00000548122 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-206ENST00000548122 KIF21BO75037 1637 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 ABCC2Q92887 1545 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 KIAA0556O60303 1618 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 RAPGEF3O95398 923 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 BCANQ96GW7 911 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 DISP1Q96F81 1524 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 GGT6Q6P531 493 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 BCL11AQ9H165 835 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM52Q96A61 297 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-206ENST00000548122 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 ATP10BO94823 1461 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 AFAP1Q8N556 730 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 HECW1Q76N89 1606 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-206ENST00000548122 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
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