RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507229.5

MIB2-222, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 2

Gene MIB2, Length 2,582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-222	ENST00000507229	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.28	■■■□□ 2.12
MIB2-222	ENST00000507229	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
MIB2-222	ENST00000507229	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
MIB2-222	ENST00000507229	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.25	■■■□□ 2.11
MIB2-222	ENST00000507229	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.25	■■■□□ 2.11
MIB2-222	ENST00000507229	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.23	■■■□□ 2.11
MIB2-222	ENST00000507229	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MIB2-222	ENST00000507229	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MIB2-222	ENST00000507229	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MIB2-222	ENST00000507229	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.17	■■■□□ 2.1
MIB2-222	ENST00000507229	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
MIB2-222	ENST00000507229	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MIB2-222	ENST00000507229	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.08	■■■□□ 2.09
MIB2-222	ENST00000507229	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.07	■■■□□ 2.08
MIB2-222	ENST00000507229	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MIB2-222	ENST00000507229	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.05	■■■□□ 2.08
MIB2-222	ENST00000507229	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
MIB2-222	ENST00000507229	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-222	ENST00000507229	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-222	ENST00000507229	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-222	ENST00000507229	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MIB2-222	ENST00000507229	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-222	ENST00000507229	NES	P48681	1621 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MIB2-222	ENST00000507229	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MIB2-222	ENST00000507229	TOPBP1	Q92547	1522 aa		27.89	■■■□□ 2.05
MIB2-222	ENST00000507229	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-222	ENST00000507229	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-222	ENST00000507229	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-222	ENST00000507229	BCAN	Q96GW7	911 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MIB2-222	ENST00000507229	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MIB2-222	ENST00000507229	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MIB2-222	ENST00000507229	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MIB2-222	ENST00000507229	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MIB2-222	ENST00000507229	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.76	■■■□□ 2.04	8e-10	■■■□□ 18.5
MIB2-222	ENST00000507229	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MIB2-222	ENST00000507229	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-222	ENST00000507229	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MIB2-222	ENST00000507229	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MIB2-222	ENST00000507229	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03	3e-6	■■■■□ 21.5
MIB2-222	ENST00000507229	CUL7	Q14999	1698 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MIB2-222	ENST00000507229	FMN1	Q68DA7	1419 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MIB2-222	ENST00000507229	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MIB2-222	ENST00000507229	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MIB2-222	ENST00000507229	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.7	■■■□□ 2.02
MIB2-222	ENST00000507229	TONSL	Q96HA7	1378 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-222	ENST00000507229	FKBP8	Q14318	412 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MIB2-222	ENST00000507229	TRIM52	Q96A61	297 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-222	ENST00000507229	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MIB2-222	ENST00000507229	ANP32C	O43423	234 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MIB2-222	ENST00000507229	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MIB2-222	ENST00000507229	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MIB2-222	ENST00000507229	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MIB2-222	ENST00000507229	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MIB2-222	ENST00000507229	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MIB2-222	ENST00000507229	NAIP	Q13075	1403 aa		27.57	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	CCER2	I3L3R5	266 aa		27.56	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	SAMD9	Q5K651	1589 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.55	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.54	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.54	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	MSH5	O43196	834 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.53	■■■□□ 2
MIB2-222	ENST00000507229	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MIB2-222	ENST00000507229	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MIB2-222	ENST00000507229	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
MIB2-222	ENST00000507229	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.45	■■□□□ 1.98
MIB2-222	ENST00000507229	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.45	■■□□□ 1.98
MIB2-222	ENST00000507229	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MIB2-222	ENST00000507229	NEFL	P07196	543 aa		27.44	■■□□□ 1.98
MIB2-222	ENST00000507229	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.42	■■□□□ 1.98
MIB2-222	ENST00000507229	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		27.41	■■□□□ 1.98
MIB2-222	ENST00000507229	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		27.39	■■□□□ 1.98
MIB2-222	ENST00000507229	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		27.39	■■□□□ 1.97
MIB2-222	ENST00000507229	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
MIB2-222	ENST00000507229	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
MIB2-222	ENST00000507229	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		27.33	■■□□□ 1.97
MIB2-222	ENST00000507229	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
MIB2-222	ENST00000507229	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.33	■■□□□ 1.97
MIB2-222	ENST00000507229	FOXD1	Q16676	465 aa		27.32	■■□□□ 1.96
MIB2-222	ENST00000507229	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		27.32	■■□□□ 1.96
MIB2-222	ENST00000507229	KDM6B	O15054	1643 aa		27.32	■■□□□ 1.96
MIB2-222	ENST00000507229	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.29	■■□□□ 1.96
MIB2-222	ENST00000507229	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		27.29	■■□□□ 1.96
MIB2-222	ENST00000507229	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
MIB2-222	ENST00000507229	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.25	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.25	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.25	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	27.24	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.22	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		27.22	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.21	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.21	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	27.2	■■□□□ 1.95
MIB2-222	ENST00000507229	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.2	■■□□□ 1.94
MIB2-222	ENST00000507229	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	27.19	■■□□□ 1.94
MIB2-222	ENST00000507229	CCDC184	Q52MB2	194 aa		27.18	■■□□□ 1.94
MIB2-222	ENST00000507229	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	27.17	■■□□□ 1.94
MIB2-222	ENST00000507229	IQGAP2	Q13576	1575 aa		27.17	■■□□□ 1.94
MIB2-222	ENST00000507229	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	27.16	■■□□□ 1.94

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