RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463118.1

AKAP9-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP9, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-208ENST00000463118 CUX1P39880 1505 aa17.73■□□□□ 0.43
AKAP9-208ENST00000463118 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
AKAP9-208ENST00000463118 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.7■□□□□ 0.42
AKAP9-208ENST00000463118 POTEDQ86YR6 584 aa17.68■□□□□ 0.42
AKAP9-208ENST00000463118 PRXQ9BXM0 1461 aa17.67■□□□□ 0.42
AKAP9-208ENST00000463118 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.67■□□□□ 0.42
AKAP9-208ENST00000463118 CLIP1P30622 1438 aa17.65■□□□□ 0.42
AKAP9-208ENST00000463118 POLA2Q14181 598 aa17.64■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.64■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.64■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 CAPN15O75808 1086 aa17.63■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 PROM2Q8N271 834 aa17.63■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 RNF39Q9H2S5 420 aa17.62■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 KIF27Q86VH2 1401 aa17.6■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.6■□□□□ 0.41
AKAP9-208ENST00000463118 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
AKAP9-208ENST00000463118 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
AKAP9-208ENST00000463118 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
AKAP9-208ENST00000463118 ARAP1Q96P48 1450 aa17.44■□□□□ 0.38
AKAP9-208ENST00000463118 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.44■□□□□ 0.38
AKAP9-208ENST00000463118 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.43■□□□□ 0.38
AKAP9-208ENST00000463118 CUX2O14529 1486 aa17.42■□□□□ 0.38
AKAP9-208ENST00000463118 IGF1RP08069 1367 aa17.41■□□□□ 0.38
AKAP9-208ENST00000463118 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.41■□□□□ 0.38
AKAP9-208ENST00000463118 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
AKAP9-208ENST00000463118 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.36■□□□□ 0.37
AKAP9-208ENST00000463118 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.32■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 TOPBP1Q92547 1522 aa17.32■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.32■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.31■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 ABCB7O75027 752 aa17.31■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 NESP48681 1621 aa17.27■□□□□ 0.36
AKAP9-208ENST00000463118 MAP3K1Q13233 1512 aa17.26■□□□□ 0.35
AKAP9-208ENST00000463118 CUL7Q14999 1698 aa17.23■□□□□ 0.35
AKAP9-208ENST00000463118 WDR97A6NE52 1622 aa17.22■□□□□ 0.35
AKAP9-208ENST00000463118 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
AKAP9-208ENST00000463118 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.2■□□□□ 0.34
AKAP9-208ENST00000463118 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
AKAP9-208ENST00000463118 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.2■□□□□ 0.34
AKAP9-208ENST00000463118 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
AKAP9-208ENST00000463118 PLCB2Q00722 1185 aa17.17■□□□□ 0.34
AKAP9-208ENST00000463118 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.14■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 TIAM1Q13009 1591 aa17.14■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.14■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.13■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.13■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 KLHL34Q8N239 644 aa17.1■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.1■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.09■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 SPDYE6P0CI01 402 aa17.09■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.09■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.09■□□□□ 0.33
AKAP9-208ENST00000463118 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.338e-7■■■□□ 18.1
AKAP9-208ENST00000463118 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.08■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.07■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 DSG3P32926 999 aa17.06■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 PKD2Q13563 968 aa17.06■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.05■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 SPOCK2Q92563 424 aa17.05■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.05■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.04■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.04■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
AKAP9-208ENST00000463118 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.02■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 SAMD9Q5K651 1589 aa16.99■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.98■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 OSCARQ8IYS5 282 aa16.97■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.97■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 FMN1Q68DA7 1419 aa16.96■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.96■□□□□ 0.31
AKAP9-208ENST00000463118 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.96■□□□□ 0.3
AKAP9-208ENST00000463118 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
AKAP9-208ENST00000463118 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.93■□□□□ 0.3
AKAP9-208ENST00000463118 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
AKAP9-208ENST00000463118 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.3
AKAP9-208ENST00000463118 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.9■□□□□ 0.3
AKAP9-208ENST00000463118 PBRM1Q86U86 1689 aa16.9■□□□□ 0.3
AKAP9-208ENST00000463118 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 MIER1Q8N108 512 aa16.87■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 GRIN2BQ13224 1484 aa16.86■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 ADAMTS12P58397 1594 aa16.86■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 PLEKHG5O94827 1062 aa16.86■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 WDR62O43379 1518 aa16.86■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 P3H3Q8IVL6 736 aa16.85■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 IFT140Q96RY7 1462 aa16.85■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
AKAP9-208ENST00000463118 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.82■□□□□ 0.28
AKAP9-208ENST00000463118 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
AKAP9-208ENST00000463118 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms