RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436447.5

AFG3L1P-211, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 5

Gene AFG3L1P, Length 3,003 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-211ENST00000436447 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.68■■□□□ 1.86
AFG3L1P-211ENST00000436447 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.67■■□□□ 1.86
AFG3L1P-211ENST00000436447 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.67■■□□□ 1.86
AFG3L1P-211ENST00000436447 ARID3CA6NKF2 412 aa26.62■■□□□ 1.85
AFG3L1P-211ENST00000436447 TRIM52Q96A61 297 aa26.61■■□□□ 1.85
AFG3L1P-211ENST00000436447 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.6■■□□□ 1.85
AFG3L1P-211ENST00000436447 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.59■■□□□ 1.85
AFG3L1P-211ENST00000436447 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.56■■□□□ 1.84
AFG3L1P-211ENST00000436447 FKBP8Q14318 412 aa26.52■■□□□ 1.84
AFG3L1P-211ENST00000436447 NESP48681 1621 aa26.5■■□□□ 1.83
AFG3L1P-211ENST00000436447 MAPKBP1O60336 1514 aa26.49■■□□□ 1.83
AFG3L1P-211ENST00000436447 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.48■■□□□ 1.83
AFG3L1P-211ENST00000436447 WDR97A6NE52 1622 aa26.47■■□□□ 1.83
AFG3L1P-211ENST00000436447 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.47■■□□□ 1.83
AFG3L1P-211ENST00000436447 TIAM1Q13009 1591 aa26.46■■□□□ 1.83
AFG3L1P-211ENST00000436447 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.45■■□□□ 1.83
AFG3L1P-211ENST00000436447 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.42■■□□□ 1.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.41■■□□□ 1.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.39■■□□□ 1.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.36■■□□□ 1.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 ANP32CO43423 234 aa26.34■■□□□ 1.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.34■■□□□ 1.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.33■■□□□ 1.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 TONSLQ96HA7 1378 aa26.31■■□□□ 1.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 NEFLP07196 543 aa26.25■■□□□ 1.79
AFG3L1P-211ENST00000436447 FOXD1Q16676 465 aa26.23■■□□□ 1.79
AFG3L1P-211ENST00000436447 TOPBP1Q92547 1522 aa26.23■■□□□ 1.79
AFG3L1P-211ENST00000436447 PRDM2Q13029 1718 aa26.23■■□□□ 1.79
AFG3L1P-211ENST00000436447 PTPRKQ15262 1439 aa26.15■■□□□ 1.78
AFG3L1P-211ENST00000436447 MYT1Q01538 1121 aa26.14■■□□□ 1.78
AFG3L1P-211ENST00000436447 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.14■■□□□ 1.77
AFG3L1P-211ENST00000436447 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.77
AFG3L1P-211ENST00000436447 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.12■■□□□ 1.77
AFG3L1P-211ENST00000436447 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.11■■□□□ 1.77
AFG3L1P-211ENST00000436447 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.11■■□□□ 1.77
AFG3L1P-211ENST00000436447 MAP3K1Q13233 1512 aa26.11■■□□□ 1.77
AFG3L1P-211ENST00000436447 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.1■■□□□ 1.77
AFG3L1P-211ENST00000436447 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.1■■□□□ 1.77
AFG3L1P-211ENST00000436447 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.07■■□□□ 1.76
AFG3L1P-211ENST00000436447 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.07■■□□□ 1.76
AFG3L1P-211ENST00000436447 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.05■■□□□ 1.76
AFG3L1P-211ENST00000436447 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
AFG3L1P-211ENST00000436447 FMN1Q68DA7 1419 aa26.03■■□□□ 1.76
AFG3L1P-211ENST00000436447 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.762e-8■■■■□ 23.2
AFG3L1P-211ENST00000436447 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
AFG3L1P-211ENST00000436447 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.98■■□□□ 1.75
AFG3L1P-211ENST00000436447 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.97■■□□□ 1.75
AFG3L1P-211ENST00000436447 CCDC184Q52MB2 194 aa25.96■■□□□ 1.75
AFG3L1P-211ENST00000436447 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
AFG3L1P-211ENST00000436447 NCOA2Q15596 1464 aa25.96■■□□□ 1.75
AFG3L1P-211ENST00000436447 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.96■■□□□ 1.75
AFG3L1P-211ENST00000436447 CCER2I3L3R5 266 aa25.94■■□□□ 1.74
AFG3L1P-211ENST00000436447 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.93■■□□□ 1.74
AFG3L1P-211ENST00000436447 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.93■■□□□ 1.74
AFG3L1P-211ENST00000436447 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
AFG3L1P-211ENST00000436447 NAIPQ13075 1403 aa25.91■■□□□ 1.74
AFG3L1P-211ENST00000436447 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.89■■□□□ 1.74
AFG3L1P-211ENST00000436447 UACAQ9BZF9 1416 aa25.89■■□□□ 1.74
AFG3L1P-211ENST00000436447 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.89■■□□□ 1.74
AFG3L1P-211ENST00000436447 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.88■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.87■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.87■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 HFM1A2PYH4 1435 aa25.87■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 CUL7Q14999 1698 aa25.86■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.84■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
AFG3L1P-211ENST00000436447 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.82■■□□□ 1.72
AFG3L1P-211ENST00000436447 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.8■■□□□ 1.72
AFG3L1P-211ENST00000436447 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.79■■□□□ 1.72
AFG3L1P-211ENST00000436447 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.78■■□□□ 1.72
AFG3L1P-211ENST00000436447 MRS2Q9HD23 443 aa25.77■■□□□ 1.72
AFG3L1P-211ENST00000436447 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
AFG3L1P-211ENST00000436447 FBLN2P98095 1184 aa25.77■■□□□ 1.72
AFG3L1P-211ENST00000436447 GRIN2BQ13224 1484 aa25.76■■□□□ 1.71
AFG3L1P-211ENST00000436447 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
AFG3L1P-211ENST00000436447 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
AFG3L1P-211ENST00000436447 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.72■■□□□ 1.71
AFG3L1P-211ENST00000436447 KDM6BO15054 1643 aa25.69■■□□□ 1.7
AFG3L1P-211ENST00000436447 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.69■■□□□ 1.7
AFG3L1P-211ENST00000436447 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.69■■□□□ 1.7
AFG3L1P-211ENST00000436447 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.69■■□□□ 1.7
AFG3L1P-211ENST00000436447 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
AFG3L1P-211ENST00000436447 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.68■■□□□ 1.7
AFG3L1P-211ENST00000436447 SAMD9Q5K651 1589 aa25.67■■□□□ 1.7
AFG3L1P-211ENST00000436447 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.63■■□□□ 1.69
AFG3L1P-211ENST00000436447 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
AFG3L1P-211ENST00000436447 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.6■■□□□ 1.69
AFG3L1P-211ENST00000436447 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
AFG3L1P-211ENST00000436447 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
AFG3L1P-211ENST00000436447 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
AFG3L1P-211ENST00000436447 MSH5O43196 834 aa25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms