RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434978.6

STXBP4-204, Transcript of syntaxin binding protein 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene STXBP4, Length 2,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STXBP4-204	ENST00000434978	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		7.57	□□□□□ -1.2
STXBP4-204	ENST00000434978	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		7.57	□□□□□ -1.2
STXBP4-204	ENST00000434978	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
STXBP4-204	ENST00000434978	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2	2e-6	■■■■□ 19.3
STXBP4-204	ENST00000434978	ARHGEF11	O15085	1522 aa		7.55	□□□□□ -1.2
STXBP4-204	ENST00000434978	CHD1	O14646	1710 aa		7.54	□□□□□ -1.2
STXBP4-204	ENST00000434978	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		7.54	□□□□□ -1.2
STXBP4-204	ENST00000434978		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
STXBP4-204	ENST00000434978	SOGA1	O94964	1423 aa		7.52	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	CUX1	P39880	1505 aa		7.52	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	GRIN2B	Q13224	1484 aa		7.52	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	SYNJ1	O43426	1573 aa		7.52	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		7.51	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		7.51	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		7.5	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	SYNJ2	O15056	1496 aa		7.5	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		7.5	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7.49	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	PBRM1	Q86U86	1689 aa		7.49	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	TOP2B	Q02880	1626 aa		7.47	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		7.47	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.47	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	ARAP1	Q96P48	1450 aa		7.46	□□□□□ -1.21
STXBP4-204	ENST00000434978	TRIM41	Q8WV44	630 aa		7.46	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	RNF39	Q9H2S5	420 aa		7.46	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		7.46	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		7.45	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	SHROOM2	Q13796	1616 aa		7.43	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	NUP160	Q12769	1436 aa		7.43	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	ADAMTS12	P58397	1594 aa		7.42	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	PLCB2	Q00722	1185 aa		7.41	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	GRIN2A	Q12879	1464 aa		7.4	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		7.4	□□□□□ -1.22
STXBP4-204	ENST00000434978	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	ARX	Q96QS3	562 aa		7.37	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	FBXO3	Q9UK99	471 aa		7.37	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	CEP170	Q5SW79	1584 aa		7.36	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	CUL7	Q14999	1698 aa		7.34	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		7.34	□□□□□ -1.23
STXBP4-204	ENST00000434978	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	FBLN2	P98095	1184 aa		7.32	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		7.32	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	MAPKBP1	O60336	1514 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	BCAN	Q96GW7	911 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STXBP4-204	ENST00000434978	KIF27	Q86VH2	1401 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		7.26	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		7.26	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		7.26	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	IGF1R	P08069	1367 aa		7.25	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		7.25	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		7.24	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		7.23	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		7.23	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	JPH4	Q96JJ6	628 aa		7.23	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	PROM2	Q8N271	834 aa		7.23	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	GLI2	P10070	1586 aa		7.22	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		7.21	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	DIP2B	Q9P265	1576 aa		7.21	□□□□□ -1.25
STXBP4-204	ENST00000434978	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		7.2	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	POLA2	Q14181	598 aa		7.2	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	IQGAP2	Q13576	1575 aa		7.2	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		7.19	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		7.19	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		7.18	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		7.18	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	ABCC2	Q92887	1545 aa		7.17	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		7.17	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		7.16	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		7.15	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
STXBP4-204	ENST00000434978	DISP1	Q96F81	1524 aa		7.15	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	CAPN15	O75808	1086 aa		7.14	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	7.14	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	PKD2	Q13563	968 aa		7.14	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	PTPRG	P23470	1445 aa		7.14	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		7.14	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	KIAA0556	O60303	1618 aa		7.14	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	GOLGA3	Q08378	1498 aa		7.14	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	KLHL34	Q8N239	644 aa		7.14	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	ABCB7	O75027	752 aa		7.13	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		7.13	□□□□□ -1.27
STXBP4-204	ENST00000434978	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		7.13	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms