RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428401.1

AC005300.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC005300.1, Length 373 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005300.1-201ENST00000428401 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.72□□□□□ -1.33
AC005300.1-201ENST00000428401 WDR62O43379 1518 aa6.67□□□□□ -1.34
AC005300.1-201ENST00000428401 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.67□□□□□ -1.34
AC005300.1-201ENST00000428401 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
AC005300.1-201ENST00000428401 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.66□□□□□ -1.34
AC005300.1-201ENST00000428401 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC005300.1-201ENST00000428401 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.65□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.65□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.62□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 TRIM41Q8WV44 630 aa6.61□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.6□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 CFTRP13569 1480 aa6.6□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.6□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 PRDM2Q13029 1718 aa6.59□□□□□ -1.35
AC005300.1-201ENST00000428401 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.54□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.54□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.54□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 PRR29P0C7W0 189 aa6.53□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 FBXO3Q9UK99 471 aa6.53□□□□□ -1.36
AC005300.1-201ENST00000428401 HAX1O00165 279 aa6.52□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.52□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 CHD1O14646 1710 aa6.5□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 CHADLQ6NUI6 762 aa6.49□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 TOPBP1Q92547 1522 aa6.49□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 ARHGEF11O15085 1522 aa6.47□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.47□□□□□ -1.37
AC005300.1-201ENST00000428401 IFT140Q96RY7 1462 aa6.46□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 EVX2Q03828 476 aa6.45□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.44□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.44□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 ARAP1Q96P48 1450 aa6.43□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.42□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 PROM2Q8N271 834 aa6.41□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 CREBZFQ9NS37 354 aa6.4□□□□□ -1.38
AC005300.1-201ENST00000428401 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 CUX1P39880 1505 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 WDR97A6NE52 1622 aa6.39□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 ABCC8Q09428 1581 aa6.38□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 PLCB2Q00722 1185 aa6.37□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.36□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.36□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 PBRM1Q86U86 1689 aa6.36□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 SOGA1O94964 1423 aa6.35□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.34□□□□□ -1.39
AC005300.1-201ENST00000428401 GABBR2O75899 941 aa6.32□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.32□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 SYNJ1O43426 1573 aa6.3□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 SYNJ2O15056 1496 aa6.29□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 GRIN2BQ13224 1484 aa6.29□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 CEP170Q5SW79 1584 aa6.28□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.28□□□□□ -1.4
AC005300.1-201ENST00000428401 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.27□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.27□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.27□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 SHROOM2Q13796 1616 aa6.26□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 CLCN6P51797 869 aa6.26□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 ADAMTS12P58397 1594 aa6.26□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.25□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 BCANQ96GW7 911 aa6.25□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 GRIN2AQ12879 1464 aa6.24□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 TOP2BQ02880 1626 aa6.24□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 NUP160Q12769 1436 aa6.24□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 MIER1Q8N108 512 aa6.23□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 PLEKHG5O94827 1062 aa6.22□□□□□ -1.41
AC005300.1-201ENST00000428401 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.21□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.2□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 POTEIP0CG38 1075 aa6.19□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 PKD2Q13563 968 aa6.19□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 PHF12Q96QT6 1004 aa6.19□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 KLHL34Q8N239 644 aa6.18□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 SPOCK2Q92563 424 aa6.18□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.18□□□□□ -1.42
AC005300.1-201ENST00000428401 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.4 ms