RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.44□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM2Q13029 1718 aa5.44□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR97A6NE52 1622 aa5.42□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD9Q5K651 1589 aa5.42□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.41□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.41□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNH8Q96L42 1107 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 HFM1A2PYH4 1435 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa5.4□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 TOPBP1Q92547 1522 aa5.4□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.4□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.4□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 DNMBPQ6XZF7 1577 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIN2BQ13224 1484 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 NAIPQ13075 1403 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 AKNAQ7Z591 1439 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 FANCD2Q9BXW9 1451 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 FHAD1B1AJZ9 1412 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 NESP48681 1621 aa5.35□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.35□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPN23Q9H3S7 1636 aa5.35□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC5BQ9UF47 199 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 UACAQ9BZF9 1416 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 NCOA2Q15596 1464 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-203ENST00000419445 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 CUL7Q14999 1698 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM6BO15054 1643 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOM3Q5VTT5 1437 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 FMN1Q68DA7 1419 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 MBD5Q9P267 1494 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 CCER2I3L3R5 266 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 GCC2Q8IWJ2 1684 aa5.28□□□□□ -1.56
PGGT1B-203ENST00000419445 HECW1Q76N89 1606 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 DISP1Q96F81 1524 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR62O43379 1518 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 APLP2Q06481 763 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 NCOA1Q15788 1441 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 MIA2Q96PC5 1412 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 GAPVD1Q14C86 1478 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS12P58397 1594 aa5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 PZPP20742 1482 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC184Q52MB2 194 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 ROCK1Q13464 1354 aa5.24□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 MSH5O43196 834 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC5O15440 1437 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRL2O95490 1459 aa5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRGP23470 1445 aa5.21□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 IQGAP2Q13576 1575 aa5.21□□□□□ -1.57
PGGT1B-203ENST00000419445 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 P3H3Q8IVL6 736 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC10Q5T3U5 1492 aa5.2□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 MTUS2Q5JR59 1369 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGAEP38570 1179 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 MYT1Q01538 1121 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 DAPK1P53355 1430 aa5.19□□□□□ -1.58
PGGT1B-203ENST00000419445 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.19□□□□□ -1.58
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