RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 PRDM2Q13029 1718 aa20.43■□□□□ 0.86
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CNGA3-204ENST00000409937 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.41■□□□□ 0.86
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CNGA3-204ENST00000409937 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.35■□□□□ 0.85
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CNGA3-204ENST00000409937 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.23■□□□□ 0.83
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CNGA3-204ENST00000409937 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CNGA3-204ENST00000409937 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.78■□□□□ 0.76
CNGA3-204ENST00000409937 NEFLP07196 543 aa19.77■□□□□ 0.76
CNGA3-204ENST00000409937 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CNGA3-204ENST00000409937 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CNGA3-204ENST00000409937 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CNGA3-204ENST00000409937 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.75
CNGA3-204ENST00000409937 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.73■□□□□ 0.75
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGEF11O15085 1522 aa19.7■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC184Q52MB2 194 aa19.7■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.66■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.66■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 PBRM1Q86U86 1689 aa19.66■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.65■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 HECW1Q76N89 1606 aa19.65■□□□□ 0.74
CNGA3-204ENST00000409937 IQGAP2Q13576 1575 aa19.64■□□□□ 0.73
CNGA3-204ENST00000409937 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ERCC6Q03468 1493 aa19.63■□□□□ 0.73
CNGA3-204ENST00000409937 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CNGA3-204ENST00000409937 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CNGA3-204ENST00000409937 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.73
CNGA3-204ENST00000409937 WDR62O43379 1518 aa19.59■□□□□ 0.73
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CNGA3-204ENST00000409937 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.59■□□□□ 0.73
CNGA3-204ENST00000409937 ADAMTS12P58397 1594 aa19.58■□□□□ 0.73
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