RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA3Q08378 1498 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP162Q5TB80 1403 aa6.25□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.24□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 NESP48681 1621 aa6.23□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.22□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.21□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF27Q86VH2 1401 aa6.21□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.21□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 SPDYE6P0CI01 402 aa6.21□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 FBLN2P98095 1184 aa6.21□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.21□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 HRCP23327 699 aa6.2□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF21BO75037 1637 aa6.2□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 PRDM2Q13029 1718 aa6.2□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCB7O75027 752 aa6.19□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 CUX2O14529 1486 aa6.19□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.19□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 CLIP1P30622 1438 aa6.18□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 PRXQ9BXM0 1461 aa6.18□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.17□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.17□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.16□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 IGF1RP08069 1367 aa6.16□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 TOPBP1Q92547 1522 aa6.16□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.16□□□□□ -1.42
LRRTM4-201ENST00000409088 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.15□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.15□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.14□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.12□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.11□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.09□□□□□ -1.43
LRRTM4-201ENST00000409088 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 ARAP1Q96P48 1450 aa6.08□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 P3H3Q8IVL6 736 aa6.08□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 POTEHQ6S545 545 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.06□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 ERCC6Q03468 1493 aa6.04□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR97A6NE52 1622 aa6.03□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.03□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.03□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 CUL7Q14999 1698 aa6.03□□□□□ -1.44
LRRTM4-201ENST00000409088 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 CLCN6P51797 869 aa6.01□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 OSCARQ8IYS5 282 aa6.01□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO3Q9UK99 471 aa6.01□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.01□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 IFT140Q96RY7 1462 aa6□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR62O43379 1518 aa6□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIN2BQ13224 1484 aa5.99□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 STAG3Q9UJ98 1225 aa5.99□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.97□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.97□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGAEP38570 1179 aa5.97□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 PBRM1Q86U86 1689 aa5.96□□□□□ -1.45
LRRTM4-201ENST00000409088 PITPNM1O00562 1244 aa5.96□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 FMN1Q68DA7 1419 aa5.96□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 TIAM1Q13009 1591 aa5.96□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTS12P58397 1594 aa5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP3K1Q13233 1512 aa5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.94□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.94□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 ARID3CA6NKF2 412 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 IQGAP2Q13576 1575 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMD9Q5K651 1589 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 MTUS2Q5JR59 1369 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIN2AQ12879 1464 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa5.91□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.91□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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