RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400436.6

SNHG11-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG11, Length 2,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG11-202ENST00000400436 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SNHG11-202ENST00000400436 MAPKBP1O60336 1514 aa22.35■■□□□ 1.17
SNHG11-202ENST00000400436 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.33■■□□□ 1.17
SNHG11-202ENST00000400436 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.33■■□□□ 1.16
SNHG11-202ENST00000400436 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SNHG11-202ENST00000400436 PRDM2Q13029 1718 aa22.31■■□□□ 1.16
SNHG11-202ENST00000400436 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SNHG11-202ENST00000400436 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.27■■□□□ 1.16
SNHG11-202ENST00000400436 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.25■■□□□ 1.15
SNHG11-202ENST00000400436 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SNHG11-202ENST00000400436 WDR97A6NE52 1622 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG11-202ENST00000400436 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG11-202ENST00000400436 MAP3K1Q13233 1512 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG11-202ENST00000400436 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG11-202ENST00000400436 BCANQ96GW7 911 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG11-202ENST00000400436 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.14■■□□□ 1.13
SNHG11-202ENST00000400436 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG11-202ENST00000400436 NESP48681 1621 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG11-202ENST00000400436 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SNHG11-202ENST00000400436 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 MYT1Q01538 1121 aa22.05■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 TOPBP1Q92547 1522 aa22.05■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 TRIM52Q96A61 297 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.03■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 FKBP8Q14318 412 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG11-202ENST00000400436 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SNHG11-202ENST00000400436 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG11-202ENST00000400436 TONSLQ96HA7 1378 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG11-202ENST00000400436 ANP32CO43423 234 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG11-202ENST00000400436 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG11-202ENST00000400436 PTPRKQ15262 1439 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG11-202ENST00000400436 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.95■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 FMN1Q68DA7 1419 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.92■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 CUL7Q14999 1698 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 33.8
SNHG11-202ENST00000400436 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 ARID3CA6NKF2 412 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.89■■□□□ 1.1
SNHG11-202ENST00000400436 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
SNHG11-202ENST00000400436 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SNHG11-202ENST00000400436 NCOA2Q15596 1464 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG11-202ENST00000400436 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG11-202ENST00000400436 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG11-202ENST00000400436 HFM1A2PYH4 1435 aa21.83■■□□□ 1.09
SNHG11-202ENST00000400436 UACAQ9BZF9 1416 aa21.83■■□□□ 1.09
SNHG11-202ENST00000400436 NEFLP07196 543 aa21.83■■□□□ 1.09
SNHG11-202ENST00000400436 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.83■■□□□ 1.08
SNHG11-202ENST00000400436 CCER2I3L3R5 266 aa21.82■■□□□ 1.08
SNHG11-202ENST00000400436 NAIPQ13075 1403 aa21.81■■□□□ 1.08
SNHG11-202ENST00000400436 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.81■■□□□ 1.08
SNHG11-202ENST00000400436 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.8■■□□□ 1.08
SNHG11-202ENST00000400436 GRIN2BQ13224 1484 aa21.76■■□□□ 1.07
SNHG11-202ENST00000400436 SAMD9Q5K651 1589 aa21.75■■□□□ 1.07
SNHG11-202ENST00000400436 FOXD1Q16676 465 aa21.74■■□□□ 1.07
SNHG11-202ENST00000400436 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SNHG11-202ENST00000400436 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.72■■□□□ 1.07
SNHG11-202ENST00000400436 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.72■■□□□ 1.07
SNHG11-202ENST00000400436 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
SNHG11-202ENST00000400436 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SNHG11-202ENST00000400436 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SNHG11-202ENST00000400436 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.67■■□□□ 1.06
SNHG11-202ENST00000400436 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.66■■□□□ 1.06
SNHG11-202ENST00000400436 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.66■■□□□ 1.06
SNHG11-202ENST00000400436 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.65■■□□□ 1.06
SNHG11-202ENST00000400436 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.65■■□□□ 1.06
SNHG11-202ENST00000400436 KDM6BO15054 1643 aa21.63■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.62■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.62■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.61■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.6■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.6■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 CCDC184Q52MB2 194 aa21.59■■□□□ 1.05
SNHG11-202ENST00000400436 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 ARHGEF11O15085 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 HECW1Q76N89 1606 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SNHG11-202ENST00000400436 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SNHG11-202ENST00000400436 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.5■■□□□ 1.03
SNHG11-202ENST00000400436 IQGAP2Q13576 1575 aa21.5■■□□□ 1.03
SNHG11-202ENST00000400436 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.48■■□□□ 1.03
SNHG11-202ENST00000400436 PBRM1Q86U86 1689 aa21.46■■□□□ 1.03
SNHG11-202ENST00000400436 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SNHG11-202ENST00000400436 MRS2Q9HD23 443 aa21.44■■□□□ 1.02
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