RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382387.3

C9orf66-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 66, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf66, Length 2,918 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf66-201ENST00000382387 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.87■■□□□ 1.73
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C9orf66-201ENST00000382387 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.8■■□□□ 1.72
C9orf66-201ENST00000382387 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.8■■□□□ 1.72
C9orf66-201ENST00000382387 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.77■■□□□ 1.72
C9orf66-201ENST00000382387 MAP3K1Q13233 1512 aa25.75■■□□□ 1.71
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C9orf66-201ENST00000382387 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.74■■□□□ 1.71
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C9orf66-201ENST00000382387 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
C9orf66-201ENST00000382387 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.96■■□□□ 1.59
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C9orf66-201ENST00000382387 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf66-201ENST00000382387 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf66-201ENST00000382387 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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C9orf66-201ENST00000382387 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.88■■□□□ 1.57
C9orf66-201ENST00000382387 PBRM1Q86U86 1689 aa24.86■■□□□ 1.57
C9orf66-201ENST00000382387 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.86■■□□□ 1.57
C9orf66-201ENST00000382387 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
C9orf66-201ENST00000382387 WDR62O43379 1518 aa24.83■■□□□ 1.57
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C9orf66-201ENST00000382387 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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