RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379655.8

KIFC3-201, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene KIFC3, Length 3,427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-201ENST00000379655 TRIM52Q96A61 297 aa26.29■■□□□ 1.8
KIFC3-201ENST00000379655 CFTRP13569 1480 aa26.27■■□□□ 1.8
KIFC3-201ENST00000379655 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.26■■□□□ 1.79
KIFC3-201ENST00000379655 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.26■■□□□ 1.79
KIFC3-201ENST00000379655 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
KIFC3-201ENST00000379655 NESP48681 1621 aa26.23■■□□□ 1.79
KIFC3-201ENST00000379655 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.21■■□□□ 1.79
KIFC3-201ENST00000379655 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.14■■□□□ 1.78
KIFC3-201ENST00000379655 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.13■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.1■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.09■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.08■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.08■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.08■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 FOXD1Q16676 465 aa26.08■■□□□ 1.77
KIFC3-201ENST00000379655 FKBP8Q14318 412 aa26.07■■□□□ 1.76
KIFC3-201ENST00000379655 HMGXB3Q12766 1538 aa26.06■■□□□ 1.76
KIFC3-201ENST00000379655 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.06■■□□□ 1.76
KIFC3-201ENST00000379655 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
KIFC3-201ENST00000379655 FBLN2P98095 1184 aa26.01■■□□□ 1.75
KIFC3-201ENST00000379655 TONSLQ96HA7 1378 aa25.98■■□□□ 1.75
KIFC3-201ENST00000379655 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.97■■□□□ 1.75
KIFC3-201ENST00000379655 ANP32CO43423 234 aa25.96■■□□□ 1.75
KIFC3-201ENST00000379655 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
KIFC3-201ENST00000379655 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.93■■□□□ 1.74
KIFC3-201ENST00000379655 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
KIFC3-201ENST00000379655 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.89■■□□□ 1.74
KIFC3-201ENST00000379655 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
KIFC3-201ENST00000379655 WDR97A6NE52 1622 aa25.88■■□□□ 1.73
KIFC3-201ENST00000379655 TIAM1Q13009 1591 aa25.87■■□□□ 1.73
KIFC3-201ENST00000379655 NEFLP07196 543 aa25.85■■□□□ 1.73
KIFC3-201ENST00000379655 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
KIFC3-201ENST00000379655 MAPKBP1O60336 1514 aa25.81■■□□□ 1.72
KIFC3-201ENST00000379655 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
KIFC3-201ENST00000379655 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
KIFC3-201ENST00000379655 TOPBP1Q92547 1522 aa25.76■■□□□ 1.71
KIFC3-201ENST00000379655 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.72■■□□□ 1.71
KIFC3-201ENST00000379655 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
KIFC3-201ENST00000379655 PTPRKQ15262 1439 aa25.69■■□□□ 1.7
KIFC3-201ENST00000379655 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.69■■□□□ 1.7
KIFC3-201ENST00000379655 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.66■■□□□ 1.7
KIFC3-201ENST00000379655 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.75e-7■■■■■ 43.5
KIFC3-201ENST00000379655 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
KIFC3-201ENST00000379655 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.62■■□□□ 1.69
KIFC3-201ENST00000379655 FMN1Q68DA7 1419 aa25.6■■□□□ 1.69
KIFC3-201ENST00000379655 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.6■■□□□ 1.69
KIFC3-201ENST00000379655 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.59■■□□□ 1.69
KIFC3-201ENST00000379655 MYT1Q01538 1121 aa25.58■■□□□ 1.69
KIFC3-201ENST00000379655 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
KIFC3-201ENST00000379655 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.57■■□□□ 1.68
KIFC3-201ENST00000379655 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
KIFC3-201ENST00000379655 CCDC184Q52MB2 194 aa25.57■■□□□ 1.68
KIFC3-201ENST00000379655 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.55■■□□□ 1.68
KIFC3-201ENST00000379655 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.54■■□□□ 1.68
KIFC3-201ENST00000379655 NCOA2Q15596 1464 aa25.54■■□□□ 1.68
KIFC3-201ENST00000379655 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.53■■□□□ 1.68
KIFC3-201ENST00000379655 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.51■■□□□ 1.67
KIFC3-201ENST00000379655 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.51■■□□□ 1.67
KIFC3-201ENST00000379655 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
KIFC3-201ENST00000379655 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.49■■□□□ 1.67
KIFC3-201ENST00000379655 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
KIFC3-201ENST00000379655 MRS2Q9HD23 443 aa25.46■■□□□ 1.67
KIFC3-201ENST00000379655 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
KIFC3-201ENST00000379655 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
KIFC3-201ENST00000379655 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.44■■□□□ 1.66
KIFC3-201ENST00000379655 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.43■■□□□ 1.66
KIFC3-201ENST00000379655 NAIPQ13075 1403 aa25.43■■□□□ 1.66
KIFC3-201ENST00000379655 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
KIFC3-201ENST00000379655 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
KIFC3-201ENST00000379655 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.38■■□□□ 1.65
KIFC3-201ENST00000379655 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.37■■□□□ 1.65
KIFC3-201ENST00000379655 UACAQ9BZF9 1416 aa25.37■■□□□ 1.65
KIFC3-201ENST00000379655 MAP3K1Q13233 1512 aa25.34■■□□□ 1.65
KIFC3-201ENST00000379655 CCER2I3L3R5 266 aa25.33■■□□□ 1.65
KIFC3-201ENST00000379655 HFM1A2PYH4 1435 aa25.33■■□□□ 1.65
KIFC3-201ENST00000379655 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.32■■□□□ 1.64
KIFC3-201ENST00000379655 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 27.8
KIFC3-201ENST00000379655 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
KIFC3-201ENST00000379655 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.28■■□□□ 1.64
KIFC3-201ENST00000379655 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.28■■□□□ 1.64
KIFC3-201ENST00000379655 RGL3Q3MIN7 710 aa25.27■■□□□ 1.64
KIFC3-201ENST00000379655 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
KIFC3-201ENST00000379655 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
KIFC3-201ENST00000379655 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.26■■□□□ 1.63
KIFC3-201ENST00000379655 PRDM2Q13029 1718 aa25.26■■□□□ 1.63
KIFC3-201ENST00000379655 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.25■■□□□ 1.63
KIFC3-201ENST00000379655 PKD2Q13563 968 aa25.25■■□□□ 1.63
KIFC3-201ENST00000379655 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.22■■□□□ 1.63
KIFC3-201ENST00000379655 GRIN2BQ13224 1484 aa25.19■■□□□ 1.62
KIFC3-201ENST00000379655 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
KIFC3-201ENST00000379655 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
KIFC3-201ENST00000379655 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.16■■□□□ 1.62
KIFC3-201ENST00000379655 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
KIFC3-201ENST00000379655 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KIFC3-201ENST00000379655 CUL7Q14999 1698 aa25.16■■□□□ 1.62
KIFC3-201ENST00000379655 KDM6BO15054 1643 aa25.15■■□□□ 1.62
KIFC3-201ENST00000379655 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
KIFC3-201ENST00000379655 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.9 ms