RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC13-201ENST00000366661 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TTC13-201ENST00000366661 IFT140Q96RY7 1462 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC13-201ENST00000366661 CUX2O14529 1486 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC13-201ENST00000366661 FKBP8Q14318 412 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC13-201ENST00000366661 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC13-201ENST00000366661 KIF27Q86VH2 1401 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC13-201ENST00000366661 CLIP1P30622 1438 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC13-201ENST00000366661 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC13-201ENST00000366661 KCNH8Q96L42 1107 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC13-201ENST00000366661 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TTC13-201ENST00000366661 P3H3Q8IVL6 736 aa22.16■■□□□ 1.14
TTC13-201ENST00000366661 APLP2Q06481 763 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC13-201ENST00000366661 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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TTC13-201ENST00000366661 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TTC13-201ENST00000366661 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.1■■□□□ 1.13
TTC13-201ENST00000366661 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.1■■□□□ 1.13
TTC13-201ENST00000366661 IGF1RP08069 1367 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC13-201ENST00000366661 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 PBRM1Q86U86 1689 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 CUL7Q14999 1698 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 NEFLP07196 543 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.05■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 KIF21BO75037 1637 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 GRIN2BQ13224 1484 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 PRXQ9BXM0 1461 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC13-201ENST00000366661 MSH5O43196 834 aa22■■□□□ 1.11
TTC13-201ENST00000366661 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.115e-11■■■■■ 39.3
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TTC13-201ENST00000366661 NBR1Q14596 966 aa21.96■■□□□ 1.11
TTC13-201ENST00000366661 TRIM52Q96A61 297 aa21.95■■□□□ 1.1
TTC13-201ENST00000366661 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TTC13-201ENST00000366661 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TTC13-201ENST00000366661 ADAMTS12P58397 1594 aa21.92■■□□□ 1.1
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TTC13-201ENST00000366661 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.9■■□□□ 1.1
TTC13-201ENST00000366661 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.88■■□□□ 1.09
TTC13-201ENST00000366661 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TTC13-201ENST00000366661 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.86■■□□□ 1.09
TTC13-201ENST00000366661 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TTC13-201ENST00000366661 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.85■■□□□ 1.09
TTC13-201ENST00000366661 ARAP1Q96P48 1450 aa21.83■■□□□ 1.08
TTC13-201ENST00000366661 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TTC13-201ENST00000366661 SYNJ2O15056 1496 aa21.81■■□□□ 1.08
TTC13-201ENST00000366661 FBLN2P98095 1184 aa21.81■■□□□ 1.08
TTC13-201ENST00000366661 ARID3CA6NKF2 412 aa21.77■■□□□ 1.08
TTC13-201ENST00000366661 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TTC13-201ENST00000366661 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC13-201ENST00000366661 GRIN2AQ12879 1464 aa21.74■■□□□ 1.07
TTC13-201ENST00000366661 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TTC13-201ENST00000366661 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC13-201ENST00000366661 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.69■■□□□ 1.06
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TTC13-201ENST00000366661 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC13-201ENST00000366661 CEP170Q5SW79 1584 aa21.59■■□□□ 1.05
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TTC13-201ENST00000366661 IQGAP2Q13576 1575 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC13-201ENST00000366661 IL27Q8NEV9 243 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC13-201ENST00000366661 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TTC13-201ENST00000366661 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC13-201ENST00000366661 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC13-201ENST00000366661 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC13-201ENST00000366661 SAMD9Q5K651 1589 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC13-201ENST00000366661 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TTC13-201ENST00000366661 SHROOM2Q13796 1616 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC13-201ENST00000366661 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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TTC13-201ENST00000366661 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.38■■□□□ 1.01
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TTC13-201ENST00000366661 KIAA0556O60303 1618 aa21.35■■□□□ 1.01
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TTC13-201ENST00000366661 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.33■■□□□ 1.01
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TTC13-201ENST00000366661 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.33■■□□□ 1
TTC13-201ENST00000366661 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
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TTC13-201ENST00000366661 TIAM1Q13009 1591 aa21.27■■□□□ 1
TTC13-201ENST00000366661 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
TTC13-201ENST00000366661 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.24■□□□□ 0.99
TTC13-201ENST00000366661 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.22■□□□□ 0.99
TTC13-201ENST00000366661 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
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TTC13-201ENST00000366661 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.21■□□□□ 0.99
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TTC13-201ENST00000366661 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.17■□□□□ 0.98
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