RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359878.7

KCTD18-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD18, Length 2,940 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18-201ENST00000359878 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.88■■■□□ 2.05
KCTD18-201ENST00000359878 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.87■■■□□ 2.05
KCTD18-201ENST00000359878 TIAM1Q13009 1591 aa27.86■■■□□ 2.05
KCTD18-201ENST00000359878 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.85■■■□□ 2.05
KCTD18-201ENST00000359878 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
KCTD18-201ENST00000359878 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.83■■■□□ 2.05
KCTD18-201ENST00000359878 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.82■■■□□ 2.04
KCTD18-201ENST00000359878 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.81■■■□□ 2.04
KCTD18-201ENST00000359878 MAPKBP1O60336 1514 aa27.77■■■□□ 2.04
KCTD18-201ENST00000359878 NESP48681 1621 aa27.76■■■□□ 2.04
KCTD18-201ENST00000359878 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
KCTD18-201ENST00000359878 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.72■■■□□ 2.03
KCTD18-201ENST00000359878 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
KCTD18-201ENST00000359878 PRDM2Q13029 1718 aa27.66■■■□□ 2.02
KCTD18-201ENST00000359878 BCANQ96GW7 911 aa27.66■■■□□ 2.02
KCTD18-201ENST00000359878 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.66■■■□□ 2.02
KCTD18-201ENST00000359878 WDR97A6NE52 1622 aa27.65■■■□□ 2.02
KCTD18-201ENST00000359878 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
KCTD18-201ENST00000359878 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
KCTD18-201ENST00000359878 ARID3CA6NKF2 412 aa27.61■■■□□ 2.01
KCTD18-201ENST00000359878 TOPBP1Q92547 1522 aa27.58■■■□□ 2.01
KCTD18-201ENST00000359878 MAP3K1Q13233 1512 aa27.57■■■□□ 2
KCTD18-201ENST00000359878 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.56■■■□□ 2
KCTD18-201ENST00000359878 TRIM52Q96A61 297 aa27.51■■■□□ 2
KCTD18-201ENST00000359878 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.5■■□□□ 1.99
KCTD18-201ENST00000359878 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.49■■□□□ 1.99
KCTD18-201ENST00000359878 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.49■■□□□ 1.99
KCTD18-201ENST00000359878 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
KCTD18-201ENST00000359878 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.47■■□□□ 1.99
KCTD18-201ENST00000359878 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.46■■□□□ 1.99
KCTD18-201ENST00000359878 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.45■■□□□ 1.99
KCTD18-201ENST00000359878 TONSLQ96HA7 1378 aa27.45■■□□□ 1.99
KCTD18-201ENST00000359878 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.44■■□□□ 1.98
KCTD18-201ENST00000359878 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.43■■□□□ 1.98
KCTD18-201ENST00000359878 FKBP8Q14318 412 aa27.41■■□□□ 1.98
KCTD18-201ENST00000359878 PTPRKQ15262 1439 aa27.4■■□□□ 1.98
KCTD18-201ENST00000359878 FMN1Q68DA7 1419 aa27.39■■□□□ 1.98
KCTD18-201ENST00000359878 ANP32CO43423 234 aa27.38■■□□□ 1.97
KCTD18-201ENST00000359878 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
KCTD18-201ENST00000359878 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.35■■□□□ 1.97
KCTD18-201ENST00000359878 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.34■■□□□ 1.97
KCTD18-201ENST00000359878 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.3■■□□□ 1.96
KCTD18-201ENST00000359878 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.29■■□□□ 1.96
KCTD18-201ENST00000359878 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.29■■□□□ 1.96
KCTD18-201ENST00000359878 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.27■■□□□ 1.96
KCTD18-201ENST00000359878 NCOA2Q15596 1464 aa27.27■■□□□ 1.96
KCTD18-201ENST00000359878 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.26■■□□□ 1.96
KCTD18-201ENST00000359878 CUL7Q14999 1698 aa27.26■■□□□ 1.95
KCTD18-201ENST00000359878 FOXD1Q16676 465 aa27.25■■□□□ 1.95
KCTD18-201ENST00000359878 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
KCTD18-201ENST00000359878 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.21■■□□□ 1.95
KCTD18-201ENST00000359878 HFM1A2PYH4 1435 aa27.2■■□□□ 1.94
KCTD18-201ENST00000359878 NAIPQ13075 1403 aa27.2■■□□□ 1.94
KCTD18-201ENST00000359878 UACAQ9BZF9 1416 aa27.19■■□□□ 1.94
KCTD18-201ENST00000359878 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
KCTD18-201ENST00000359878 NEFLP07196 543 aa27.18■■□□□ 1.94
KCTD18-201ENST00000359878 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.15■■□□□ 1.94
KCTD18-201ENST00000359878 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.12■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 GRIN2BQ13224 1484 aa27.12■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.11■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 CCER2I3L3R5 266 aa27.1■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.09■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
KCTD18-201ENST00000359878 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.06■■□□□ 1.92
KCTD18-201ENST00000359878 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.06■■□□□ 1.92
KCTD18-201ENST00000359878 SAMD9Q5K651 1589 aa27.05■■□□□ 1.92
KCTD18-201ENST00000359878 MYT1Q01538 1121 aa27.05■■□□□ 1.92
KCTD18-201ENST00000359878 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
KCTD18-201ENST00000359878 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
KCTD18-201ENST00000359878 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.01■■□□□ 1.91
KCTD18-201ENST00000359878 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27■■□□□ 1.91
KCTD18-201ENST00000359878 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
KCTD18-201ENST00000359878 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27■■□□□ 1.91
KCTD18-201ENST00000359878 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.99■■□□□ 1.91
KCTD18-201ENST00000359878 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.97■■□□□ 1.91
KCTD18-201ENST00000359878 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.96■■□□□ 1.91
KCTD18-201ENST00000359878 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 CCDC184Q52MB2 194 aa26.94■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 KDM6BO15054 1643 aa26.94■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.92■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.9■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
KCTD18-201ENST00000359878 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.88■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 FBLN2P98095 1184 aa26.87■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.86■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 IQGAP2Q13576 1575 aa26.84■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.83■■□□□ 1.89
KCTD18-201ENST00000359878 HECW1Q76N89 1606 aa26.81■■□□□ 1.88
KCTD18-201ENST00000359878 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
KCTD18-201ENST00000359878 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms