RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339711.8

PRDM8-201, Transcript of PR/SET domain 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM8, Length 4,095 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8-201ENST00000339711 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PRDM8-201ENST00000339711 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM8-201ENST00000339711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM8-201ENST00000339711 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRDM8-201ENST00000339711 TOPBP1Q92547 1522 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM8-201ENST00000339711 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM8-201ENST00000339711 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.56■■□□□ 1.36
PRDM8-201ENST00000339711 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.54■■□□□ 1.36
PRDM8-201ENST00000339711 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PRDM8-201ENST00000339711 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.52■■□□□ 1.36
PRDM8-201ENST00000339711 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.51■■□□□ 1.35
PRDM8-201ENST00000339711 FMN1Q68DA7 1419 aa23.5■■□□□ 1.35
PRDM8-201ENST00000339711 ARAP1Q96P48 1450 aa23.48■■□□□ 1.35
PRDM8-201ENST00000339711 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM8-201ENST00000339711 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM8-201ENST00000339711 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.43■■□□□ 1.34
PRDM8-201ENST00000339711 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM8-201ENST00000339711 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM8-201ENST00000339711 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PRDM8-201ENST00000339711 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.36■■□□□ 1.33
PRDM8-201ENST00000339711 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.35■■□□□ 1.33
PRDM8-201ENST00000339711 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.35■■□□□ 1.33
PRDM8-201ENST00000339711 TONSLQ96HA7 1378 aa23.34■■□□□ 1.33
PRDM8-201ENST00000339711 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PRDM8-201ENST00000339711 BCANQ96GW7 911 aa23.32■■□□□ 1.32
PRDM8-201ENST00000339711 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.3■■□□□ 1.32
PRDM8-201ENST00000339711 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PRDM8-201ENST00000339711 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PRDM8-201ENST00000339711 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.26■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.23■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 TSPY4P0CV99 314 aa23.23■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 TSPY10P0CW01 314 aa23.23■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.22■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 JPH4Q96JJ6 628 aa23.22■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 GRIN2BQ13224 1484 aa23.22■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.21■■□□□ 1.31
PRDM8-201ENST00000339711 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.16■■□□□ 1.3
PRDM8-201ENST00000339711 KCNH8Q96L42 1107 aa23.15■■□□□ 1.3
PRDM8-201ENST00000339711 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.15■■□□□ 1.3
PRDM8-201ENST00000339711 IFT140Q96RY7 1462 aa23.14■■□□□ 1.3
PRDM8-201ENST00000339711 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.14■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 MIER1Q8N108 512 aa23.12■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 MYT1Q01538 1121 aa23.11■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 ANP32CO43423 234 aa23.1■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.1■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PRDM8-201ENST00000339711 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PRDM8-201ENST00000339711 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.06■■□□□ 1.28
PRDM8-201ENST00000339711 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
PRDM8-201ENST00000339711 CUL7Q14999 1698 aa23.05■■□□□ 1.28
PRDM8-201ENST00000339711 TIAM1Q13009 1591 aa23.01■■□□□ 1.27
PRDM8-201ENST00000339711 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
PRDM8-201ENST00000339711 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23■■□□□ 1.27
PRDM8-201ENST00000339711 PRDM2Q13029 1718 aa23■■□□□ 1.27
PRDM8-201ENST00000339711 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM8-201ENST00000339711 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM8-201ENST00000339711 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PRDM8-201ENST00000339711 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM8-201ENST00000339711 NCOA2Q15596 1464 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM8-201ENST00000339711 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PRDM8-201ENST00000339711 PTPRGP23470 1445 aa22.89■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.86■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 MAP3K1Q13233 1512 aa22.86■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 FOXD1Q16676 465 aa22.85■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.85■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.84■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.84■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 IQGAP2Q13576 1575 aa22.84■■□□□ 1.25
PRDM8-201ENST00000339711 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PRDM8-201ENST00000339711 GRIN2AQ12879 1464 aa22.77■■□□□ 1.24
PRDM8-201ENST00000339711 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
PRDM8-201ENST00000339711 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.75■■□□□ 1.23
PRDM8-201ENST00000339711 SYNJ2O15056 1496 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM8-201ENST00000339711 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM8-201ENST00000339711 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PRDM8-201ENST00000339711 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PRDM8-201ENST00000339711 PKD2Q13563 968 aa22.72■■□□□ 1.23
PRDM8-201ENST00000339711 RGL3Q3MIN7 710 aa22.71■■□□□ 1.23
PRDM8-201ENST00000339711 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 HECW1Q76N89 1606 aa22.7■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.67■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 NUP155O75694 1391 aa22.66■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 FKBP8Q14318 412 aa22.66■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.65■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 UACAQ9BZF9 1416 aa22.65■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.64■■□□□ 1.22
PRDM8-201ENST00000339711 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PRDM8-201ENST00000339711 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.63■■□□□ 1.21
PRDM8-201ENST00000339711 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.62■■□□□ 1.21
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