RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334205.8

RPS6KA4-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA4, Length 3,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4-201ENST00000334205 IGF1RP08069 1367 aa20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 NCAPD3P42695 1498 aa20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 TRIM52Q96A61 297 aa20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 WDR97A6NE52 1622 aa20.41■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.4■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 CFTRP13569 1480 aa20.4■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 TIAM1Q13009 1591 aa20.37■□□□□ 0.85
RPS6KA4-201ENST00000334205 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.35■□□□□ 0.85
RPS6KA4-201ENST00000334205 HMGXB3Q12766 1538 aa20.34■□□□□ 0.85
RPS6KA4-201ENST00000334205 ARID3CA6NKF2 412 aa20.33■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 BCL11AQ9H165 835 aa20.33■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.29■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.29■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 ANP32CO43423 234 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 NEFLP07196 543 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 TONSLQ96HA7 1378 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA4-201ENST00000334205 NESP48681 1621 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA4-201ENST00000334205 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA4-201ENST00000334205 MAP3K1Q13233 1512 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA4-201ENST00000334205 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.12■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.12■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 CCER2I3L3R5 266 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.08■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 PTPRKQ15262 1439 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 PRDM2Q13029 1718 aa20.04■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.02■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.01■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 27.6
RPS6KA4-201ENST00000334205 FOXD1Q16676 465 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 UACAQ9BZF9 1416 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 CCDC184Q52MB2 194 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 FMN1Q68DA7 1419 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 HFM1A2PYH4 1435 aa19.91■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 NAIPQ13075 1403 aa19.91■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 TOPBP1Q92547 1522 aa19.91■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.91■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.9■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 NCOA2Q15596 1464 aa19.9■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.89■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.89■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 MSH5O43196 834 aa19.88■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.87■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.86■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.86■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.85■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.84■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.82■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.81■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.8■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 MRS2Q9HD23 443 aa19.79■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.78■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 KDM5BQ9UGL1 1544 aa19.78■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 CUL7Q14999 1698 aa19.77■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.77■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.77■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 FBLN2P98095 1184 aa19.76■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 GRIN2BQ13224 1484 aa19.74■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.74■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.74■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 KDM6BO15054 1643 aa19.74■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.71■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.68■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.68■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.68■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 SAMD9Q5K651 1589 aa19.67■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.67■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 CCDC7Q96M83 1385 aa19.66■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms