RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334205.8

RPS6KA4-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA4, Length 3,119 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4-201ENST00000334205 IGF1RP08069 1367 aa20.44■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 NCAPD3P42695 1498 aa20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 TRIM52Q96A61 297 aa20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.43■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 WDR97A6NE52 1622 aa20.41■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.4■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 CFTRP13569 1480 aa20.4■□□□□ 0.86
RPS6KA4-201ENST00000334205 TIAM1Q13009 1591 aa20.37■□□□□ 0.85
RPS6KA4-201ENST00000334205 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.35■□□□□ 0.85
RPS6KA4-201ENST00000334205 HMGXB3Q12766 1538 aa20.34■□□□□ 0.85
RPS6KA4-201ENST00000334205 ARID3CA6NKF2 412 aa20.33■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 BCL11AQ9H165 835 aa20.33■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.29■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.29■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 ANP32CO43423 234 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 NEFLP07196 543 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA4-201ENST00000334205 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA4-201ENST00000334205 TONSLQ96HA7 1378 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA4-201ENST00000334205 NESP48681 1621 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA4-201ENST00000334205 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA4-201ENST00000334205 MAP3K1Q13233 1512 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA4-201ENST00000334205 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.12■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.12■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 CCER2I3L3R5 266 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS6KA4-201ENST00000334205 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.08■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 PTPRKQ15262 1439 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 PRDM2Q13029 1718 aa20.04■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.02■□□□□ 0.8
RPS6KA4-201ENST00000334205 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.01■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 27.6
RPS6KA4-201ENST00000334205 FOXD1Q16676 465 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA4-201ENST00000334205 UACAQ9BZF9 1416 aa19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 CCDC184Q52MB2 194 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 FMN1Q68DA7 1419 aa19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 HFM1A2PYH4 1435 aa19.91■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 NAIPQ13075 1403 aa19.91■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 TOPBP1Q92547 1522 aa19.91■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.91■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.9■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 NCOA2Q15596 1464 aa19.9■□□□□ 0.78
RPS6KA4-201ENST00000334205 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.89■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.89■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 MSH5O43196 834 aa19.88■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.87■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.86■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.86■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.85■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.84■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
RPS6KA4-201ENST00000334205 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.82■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.81■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.8■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 MRS2Q9HD23 443 aa19.79■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.78■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 KDM5BQ9UGL1 1544 aa19.78■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 CUL7Q14999 1698 aa19.77■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.77■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.77■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
RPS6KA4-201ENST00000334205 FBLN2P98095 1184 aa19.76■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 GRIN2BQ13224 1484 aa19.74■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.74■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.74■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 KDM6BO15054 1643 aa19.74■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.71■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RPS6KA4-201ENST00000334205 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.68■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.68■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.68■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 SAMD9Q5K651 1589 aa19.67■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.67■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 CCDC7Q96M83 1385 aa19.66■□□□□ 0.74
RPS6KA4-201ENST00000334205 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms