RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329397.5

PTP4A3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTP4A3, Length 2,785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3-201ENST00000329397 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.12■■□□□ 1.61
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PTP4A3-201ENST00000329397 PRDM2Q13029 1718 aa25.1■■□□□ 1.61
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PTP4A3-201ENST00000329397 FMN1Q68DA7 1419 aa24.6■■□□□ 1.53
PTP4A3-201ENST00000329397 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.59■■□□□ 1.53
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PTP4A3-201ENST00000329397 CCDC184Q52MB2 194 aa24.24■■□□□ 1.47
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PTP4A3-201ENST00000329397 ARHGEF11O15085 1522 aa24.23■■□□□ 1.47
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PTP4A3-201ENST00000329397 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.18■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
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PTP4A3-201ENST00000329397 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.16■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTP4A3-201ENST00000329397 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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PTP4A3-201ENST00000329397 PBRM1Q86U86 1689 aa24.13■■□□□ 1.45
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