RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.32■■■□□ 2.12
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SPNS2-201ENST00000329078 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.31■■■□□ 2.12
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SPNS2-201ENST00000329078 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.29■■■□□ 2.12
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SPNS2-201ENST00000329078 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.84■■■□□ 2.05
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SPNS2-201ENST00000329078 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.67■■■□□ 2.02
SPNS2-201ENST00000329078 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.67■■■□□ 2.02
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.66■■■□□ 2.02
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SPNS2-201ENST00000329078 MRS2Q9HD23 443 aa27.44■■□□□ 1.98
SPNS2-201ENST00000329078 UACAQ9BZF9 1416 aa27.44■■□□□ 1.98
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC184Q52MB2 194 aa27.44■■□□□ 1.98
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SPNS2-201ENST00000329078 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
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SPNS2-201ENST00000329078 GRIN2BQ13224 1484 aa27.21■■□□□ 1.95
SPNS2-201ENST00000329078 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.2■■□□□ 1.94
SPNS2-201ENST00000329078 PKD2Q13563 968 aa27.19■■□□□ 1.94
SPNS2-201ENST00000329078 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.19■■□□□ 1.94
SPNS2-201ENST00000329078 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
SPNS2-201ENST00000329078 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
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