RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327284.12

SENP6-201, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SENP6, Length 2,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-201ENST00000327284 NESP48681 1621 aa27.7■■■□□ 2.02
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SENP6-201ENST00000327284 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.65■■■□□ 2.02
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SENP6-201ENST00000327284 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.62■■■□□ 2.01
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SENP6-201ENST00000327284 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.17■■□□□ 1.94
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SENP6-201ENST00000327284 TONSLQ96HA7 1378 aa27.06■■□□□ 1.92
SENP6-201ENST00000327284 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.06■■□□□ 1.92
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SENP6-201ENST00000327284 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.03■■□□□ 1.92
SENP6-201ENST00000327284 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
SENP6-201ENST00000327284 TRIM52Q96A61 297 aa27■■□□□ 1.91
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SENP6-201ENST00000327284 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.99■■□□□ 1.91
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SENP6-201ENST00000327284 HFM1A2PYH4 1435 aa26.97■■□□□ 1.91
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SENP6-201ENST00000327284 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SENP6-201ENST00000327284 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SENP6-201ENST00000327284 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SENP6-201ENST00000327284 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.82■■□□□ 1.88
SENP6-201ENST00000327284 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.81■■□□□ 1.88
SENP6-201ENST00000327284 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP6-201ENST00000327284 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SENP6-201ENST00000327284 KDM6BO15054 1643 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP6-201ENST00000327284 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SENP6-201ENST00000327284 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SENP6-201ENST00000327284 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SENP6-201ENST00000327284 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SENP6-201ENST00000327284 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.73■■□□□ 1.87
SENP6-201ENST00000327284 CCER2I3L3R5 266 aa26.72■■□□□ 1.87
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SENP6-201ENST00000327284 ARHGEF11O15085 1522 aa26.71■■□□□ 1.87
SENP6-201ENST00000327284 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.71■■□□□ 1.87
SENP6-201ENST00000327284 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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SENP6-201ENST00000327284 ADAMTS12P58397 1594 aa26.64■■□□□ 1.85
SENP6-201ENST00000327284 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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SENP6-201ENST00000327284 WDR62O43379 1518 aa26.59■■□□□ 1.85
SENP6-201ENST00000327284 NEFLP07196 543 aa26.59■■□□□ 1.85
SENP6-201ENST00000327284 CCDC184Q52MB2 194 aa26.59■■□□□ 1.85
SENP6-201ENST00000327284 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
SENP6-201ENST00000327284 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SENP6-201ENST00000327284 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SENP6-201ENST00000327284 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SENP6-201ENST00000327284 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.56■■□□□ 1.84
SENP6-201ENST00000327284 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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