RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320225.9

RNPS1-202, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPS1, Length 2,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-202ENST00000320225 KIF27Q86VH2 1401 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-202ENST00000320225 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-202ENST00000320225 CFTRP13569 1480 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-202ENST00000320225 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-202ENST00000320225 MSH5O43196 834 aa25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-202ENST00000320225 CCER2I3L3R5 266 aa25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-202ENST00000320225 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-202ENST00000320225 TIAM1Q13009 1591 aa25.08■■□□□ 1.61
RNPS1-202ENST00000320225 MAP3K1Q13233 1512 aa25.08■■□□□ 1.6
RNPS1-202ENST00000320225 NEFLP07196 543 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-202ENST00000320225 TRIM52Q96A61 297 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-202ENST00000320225 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-202ENST00000320225 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-202ENST00000320225 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-202ENST00000320225 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-202ENST00000320225 PRDM2Q13029 1718 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-202ENST00000320225 ANP32CO43423 234 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-202ENST00000320225 IGF1RP08069 1367 aa24.92■■□□□ 1.58
RNPS1-202ENST00000320225 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.91■■□□□ 1.58
RNPS1-202ENST00000320225 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.86■■□□□ 1.57
RNPS1-202ENST00000320225 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
RNPS1-202ENST00000320225 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.79■■□□□ 1.56
RNPS1-202ENST00000320225 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.79■■□□□ 1.56
RNPS1-202ENST00000320225 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.79■■□□□ 1.56
RNPS1-202ENST00000320225 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.78■■□□□ 1.56
RNPS1-202ENST00000320225 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RNPS1-202ENST00000320225 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
RNPS1-202ENST00000320225 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 26.4
RNPS1-202ENST00000320225 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
RNPS1-202ENST00000320225 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.69■■□□□ 1.54
RNPS1-202ENST00000320225 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.69■■□□□ 1.54
RNPS1-202ENST00000320225 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
RNPS1-202ENST00000320225 TONSLQ96HA7 1378 aa24.65■■□□□ 1.54
RNPS1-202ENST00000320225 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-202ENST00000320225 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-202ENST00000320225 UACAQ9BZF9 1416 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-202ENST00000320225 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 P3H3Q8IVL6 736 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 PTPRKQ15262 1439 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 HFM1A2PYH4 1435 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-202ENST00000320225 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.51■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.513e-7■■■■□ 22.2
RNPS1-202ENST00000320225 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.5■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 CCDC184Q52MB2 194 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 NCOA2Q15596 1464 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 NAIPQ13075 1403 aa24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-202ENST00000320225 TOPBP1Q92547 1522 aa24.45■■□□□ 1.5
RNPS1-202ENST00000320225 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RNPS1-202ENST00000320225 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-202ENST00000320225 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-202ENST00000320225 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.41■■□□□ 1.5
RNPS1-202ENST00000320225 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.41■■□□□ 1.5
RNPS1-202ENST00000320225 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.39■■□□□ 1.49
RNPS1-202ENST00000320225 NESP48681 1621 aa24.39■■□□□ 1.49
RNPS1-202ENST00000320225 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RNPS1-202ENST00000320225 CUL7Q14999 1698 aa24.38■■□□□ 1.49
RNPS1-202ENST00000320225 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.37■■□□□ 1.49
RNPS1-202ENST00000320225 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.36■■□□□ 1.49
RNPS1-202ENST00000320225 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.34■■□□□ 1.49
RNPS1-202ENST00000320225 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 FMN1Q68DA7 1419 aa24.31■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 NCOA1Q15788 1441 aa24.3■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 HECW1Q76N89 1606 aa24.28■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.28■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 CCDC7Q96M83 1385 aa24.27■■□□□ 1.48
RNPS1-202ENST00000320225 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.26■■□□□ 1.47
RNPS1-202ENST00000320225 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.26■■□□□ 1.47
RNPS1-202ENST00000320225 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RNPS1-202ENST00000320225 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.24■■□□□ 1.47
RNPS1-202ENST00000320225 SAMD9Q5K651 1589 aa24.23■■□□□ 1.47
RNPS1-202ENST00000320225 MRS2Q9HD23 443 aa24.22■■□□□ 1.47
RNPS1-202ENST00000320225 KDM6BO15054 1643 aa24.21■■□□□ 1.47
RNPS1-202ENST00000320225 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.19■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 NBR1Q14596 966 aa24.19■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 ARHGEF11O15085 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 GRIN2BQ13224 1484 aa24.18■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.17■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.17■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 AKNAQ7Z591 1439 aa24.15■■□□□ 1.46
RNPS1-202ENST00000320225 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.15■■□□□ 1.46
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