RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 FKBP8Q14318 412 aa9.02□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 NCAPD3P42695 1498 aa9.01□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 ERCC6Q03468 1493 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 TONSLQ96HA7 1378 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 BCL11AQ9H165 835 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 TIAM1Q13009 1591 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.96□□□□□ -0.97
LMO3-202ENST00000320122 CFTRP13569 1480 aa8.96□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 CUX1P39880 1505 aa8.95□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.94□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 BCANQ96GW7 911 aa8.93□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 FMN1Q68DA7 1419 aa8.92□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 MAPKBP1O60336 1514 aa8.92□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.92□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 IGF1RP08069 1367 aa8.91□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.91□□□□□ -0.98
LMO3-202ENST00000320122 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.89□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 UACAQ9BZF9 1416 aa8.88□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 WDR97A6NE52 1622 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.87□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 PRDM2Q13029 1718 aa8.86□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 TRIM52Q96A61 297 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.85□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 HFM1A2PYH4 1435 aa8.84□□□□□ -0.99
LMO3-202ENST00000320122 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.82□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 CUL7Q14999 1698 aa8.82□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 KCNH8Q96L42 1107 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 SLC24A1O60721 1099 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 AKNAQ7Z591 1439 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 P3H3Q8IVL6 736 aa8.77□□□□□ -1
LMO3-202ENST00000320122 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.77□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.77□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 MRS2Q9HD23 443 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 NAIPQ13075 1403 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 NCOA2Q15596 1464 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 MIA2Q96PC5 1412 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
LMO3-202ENST00000320122 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 CCDC7Q96M83 1385 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 HECW1Q76N89 1606 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 ROCK1Q13464 1354 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 TOPBP1Q92547 1522 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 NCOA1Q15788 1441 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 GRIN2BQ13224 1484 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 NUDCQ9Y266 331 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-202ENST00000320122 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.66□□□□□ -1.02
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