RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 IFT140Q96RY7 1462 aa27.69■■■□□ 2.02
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MVB12A-201ENST00000317040 KIF27Q86VH2 1401 aa27.36■■□□□ 1.97
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MVB12A-201ENST00000317040 MAP3K1Q13233 1512 aa27.2■■□□□ 1.95
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MVB12A-201ENST00000317040 KCNH8Q96L42 1107 aa27.15■■□□□ 1.94
MVB12A-201ENST00000317040 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.14■■□□□ 1.93
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MVB12A-201ENST00000317040 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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MVB12A-201ENST00000317040 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.09■■□□□ 1.93
MVB12A-201ENST00000317040 SYNJ2O15056 1496 aa27.08■■□□□ 1.93
MVB12A-201ENST00000317040 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.07■■□□□ 1.92
MVB12A-201ENST00000317040 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.07■■□□□ 1.92
MVB12A-201ENST00000317040 ADAMTS12P58397 1594 aa27.06■■□□□ 1.92
MVB12A-201ENST00000317040 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.04■■□□□ 1.92
MVB12A-201ENST00000317040 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.04■■□□□ 1.92
MVB12A-201ENST00000317040 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
MVB12A-201ENST00000317040 CUL7Q14999 1698 aa27.01■■□□□ 1.91
MVB12A-201ENST00000317040 TIAM1Q13009 1591 aa27.01■■□□□ 1.91
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MVB12A-201ENST00000317040 CHD1O14646 1710 aa26.97■■□□□ 1.91
MVB12A-201ENST00000317040 GRIN2AQ12879 1464 aa26.96■■□□□ 1.91
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MVB12A-201ENST00000317040 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.73■■□□□ 1.87
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MVB12A-201ENST00000317040 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.72■■□□□ 1.87
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MVB12A-201ENST00000317040 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.42■■□□□ 1.82
MVB12A-201ENST00000317040 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
MVB12A-201ENST00000317040 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.4■■□□□ 1.82
MVB12A-201ENST00000317040 DISP1Q96F81 1524 aa26.4■■□□□ 1.82
MVB12A-201ENST00000317040 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.38■■□□□ 1.81
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MVB12A-201ENST00000317040 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.37■■□□□ 1.81
MVB12A-201ENST00000317040 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.37■■□□□ 1.81
MVB12A-201ENST00000317040 P3H3Q8IVL6 736 aa26.35■■□□□ 1.81
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