RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312553.9

PODN-201, Transcript of podocan, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PODN, Length 3,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODN-201ENST00000312553 TRIM52Q96A61 297 aa22.05■■□□□ 1.12
PODN-201ENST00000312553 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.04■■□□□ 1.12
PODN-201ENST00000312553 WDR97A6NE52 1622 aa22.03■■□□□ 1.12
PODN-201ENST00000312553 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PODN-201ENST00000312553 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PODN-201ENST00000312553 NEFLP07196 543 aa21.99■■□□□ 1.11
PODN-201ENST00000312553 P3H3Q8IVL6 736 aa21.99■■□□□ 1.11
PODN-201ENST00000312553 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.96■■□□□ 1.11
PODN-201ENST00000312553 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PODN-201ENST00000312553 ANP32CO43423 234 aa21.93■■□□□ 1.1
PODN-201ENST00000312553 TIAM1Q13009 1591 aa21.91■■□□□ 1.1
PODN-201ENST00000312553 IGF1RP08069 1367 aa21.91■■□□□ 1.1
PODN-201ENST00000312553 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.89■■□□□ 1.09
PODN-201ENST00000312553 CCER2I3L3R5 266 aa21.85■■□□□ 1.09
PODN-201ENST00000312553 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.85■■□□□ 1.09
PODN-201ENST00000312553 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.84■■□□□ 1.09
PODN-201ENST00000312553 CFTRP13569 1480 aa21.82■■□□□ 1.08
PODN-201ENST00000312553 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.82■■□□□ 1.08
PODN-201ENST00000312553 NCAPD3P42695 1498 aa21.81■■□□□ 1.08
PODN-201ENST00000312553 MAP3K1Q13233 1512 aa21.79■■□□□ 1.08
PODN-201ENST00000312553 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PODN-201ENST00000312553 HMGXB3Q12766 1538 aa21.75■■□□□ 1.07
PODN-201ENST00000312553 TONSLQ96HA7 1378 aa21.74■■□□□ 1.07
PODN-201ENST00000312553 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.73■■□□□ 1.07
PODN-201ENST00000312553 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
PODN-201ENST00000312553 MSH5O43196 834 aa21.69■■□□□ 1.06
PODN-201ENST00000312553 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.69■■□□□ 1.06
PODN-201ENST00000312553 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PODN-201ENST00000312553 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.65■■□□□ 1.06
PODN-201ENST00000312553 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.6■■□□□ 1.05
PODN-201ENST00000312553 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PODN-201ENST00000312553 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.57■■□□□ 1.04
PODN-201ENST00000312553 PTPRKQ15262 1439 aa21.55■■□□□ 1.04
PODN-201ENST00000312553 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.55■■□□□ 1.04
PODN-201ENST00000312553 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.55■■□□□ 1.04
PODN-201ENST00000312553 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
PODN-201ENST00000312553 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.52■■□□□ 1.04
PODN-201ENST00000312553 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.52■■□□□ 1.04
PODN-201ENST00000312553 UACAQ9BZF9 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.51■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 CCDC184Q52MB2 194 aa21.5■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.5■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.48■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.48■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.47■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.47■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 HFM1A2PYH4 1435 aa21.47■■□□□ 1.03
PODN-201ENST00000312553 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.45■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 PRDM2Q13029 1718 aa21.44■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 NAIPQ13075 1403 aa21.44■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.43■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.42■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.4■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 FMN1Q68DA7 1419 aa21.4■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.39■■□□□ 1.02
PODN-201ENST00000312553 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.38■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.38■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 FOXD1Q16676 465 aa21.36■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 NCOA2Q15596 1464 aa21.35■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.35■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 MRS2Q9HD23 443 aa21.34■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.34■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.33■■□□□ 1.01
PODN-201ENST00000312553 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PODN-201ENST00000312553 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PODN-201ENST00000312553 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.32■■□□□ 1
PODN-201ENST00000312553 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.31■■□□□ 1
PODN-201ENST00000312553 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PODN-201ENST00000312553 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.29■■□□□ 1
PODN-201ENST00000312553 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.28■■□□□ 1
PODN-201ENST00000312553 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.27■■□□□ 1
PODN-201ENST00000312553 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.25■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 ARID3CA6NKF2 412 aa21.25■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 TOPBP1Q92547 1522 aa21.24■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.23■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 CCDC7Q96M83 1385 aa21.23■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.22■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.22■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.22■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.21■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.21■□□□□ 0.99
PODN-201ENST00000312553 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 CUL7Q14999 1698 aa21.19■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 GRIN2BQ13224 1484 aa21.19■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 KDM6BO15054 1643 aa21.18■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 NESP48681 1621 aa21.17■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 NCOA1Q15788 1441 aa21.17■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.17■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 NBR1Q14596 966 aa21.16■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.15■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.15■□□□□ 0.98
PODN-201ENST00000312553 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.8 ms