RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299543.8

CTDP1-202, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CTDP1, Length 3,380 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-202ENST00000299543 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
CTDP1-202ENST00000299543 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.33■□□□□ 0.68
CTDP1-202ENST00000299543 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.31■□□□□ 0.68
CTDP1-202ENST00000299543 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CTDP1-202ENST00000299543 BCANQ96GW7 911 aa19.28■□□□□ 0.68
CTDP1-202ENST00000299543 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CTDP1-202ENST00000299543 KCNH8Q96L42 1107 aa19.25■□□□□ 0.67
CTDP1-202ENST00000299543 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.24■□□□□ 0.67
CTDP1-202ENST00000299543 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.23■□□□□ 0.67
CTDP1-202ENST00000299543 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.22■□□□□ 0.67
CTDP1-202ENST00000299543 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDP1-202ENST00000299543 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.19■□□□□ 0.66
CTDP1-202ENST00000299543 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.16■□□□□ 0.66
CTDP1-202ENST00000299543 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDP1-202ENST00000299543 NESP48681 1621 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDP1-202ENST00000299543 TIAM1Q13009 1591 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDP1-202ENST00000299543 ARID3CA6NKF2 412 aa19.13■□□□□ 0.65
CTDP1-202ENST00000299543 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CTDP1-202ENST00000299543 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.11■□□□□ 0.65
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CTDP1-202ENST00000299543 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.06■□□□□ 0.64
CTDP1-202ENST00000299543 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.05■□□□□ 0.64
CTDP1-202ENST00000299543 MAPKBP1O60336 1514 aa19.04■□□□□ 0.64
CTDP1-202ENST00000299543 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CTDP1-202ENST00000299543 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CTDP1-202ENST00000299543 TOPBP1Q92547 1522 aa19■□□□□ 0.63
CTDP1-202ENST00000299543 TRIM52Q96A61 297 aa19■□□□□ 0.63
CTDP1-202ENST00000299543 WDR97A6NE52 1622 aa18.99■□□□□ 0.63
CTDP1-202ENST00000299543 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CTDP1-202ENST00000299543 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.99■□□□□ 0.63
CTDP1-202ENST00000299543 TONSLQ96HA7 1378 aa18.99■□□□□ 0.63
CTDP1-202ENST00000299543 MAP3K1Q13233 1512 aa18.96■□□□□ 0.63
CTDP1-202ENST00000299543 ANP32CO43423 234 aa18.96■□□□□ 0.63
CTDP1-202ENST00000299543 PRDM2Q13029 1718 aa18.95■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.94■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.93■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 FKBP8Q14318 412 aa18.93■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.92■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 MSH5O43196 834 aa18.92■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 FMN1Q68DA7 1419 aa18.92■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.9■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.9■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.89■□□□□ 0.62
CTDP1-202ENST00000299543 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.86■□□□□ 0.61
CTDP1-202ENST00000299543 PTPRKQ15262 1439 aa18.84■□□□□ 0.61
CTDP1-202ENST00000299543 NEFLP07196 543 aa18.84■□□□□ 0.61
CTDP1-202ENST00000299543 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CTDP1-202ENST00000299543 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.84■□□□□ 0.61
CTDP1-202ENST00000299543 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.83■□□□□ 0.61
CTDP1-202ENST00000299543 FOXD1Q16676 465 aa18.83■□□□□ 0.6
CTDP1-202ENST00000299543 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.81■□□□□ 0.6
CTDP1-202ENST00000299543 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.8■□□□□ 0.6
CTDP1-202ENST00000299543 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
CTDP1-202ENST00000299543 NCOA2Q15596 1464 aa18.79■□□□□ 0.6
CTDP1-202ENST00000299543 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.77■□□□□ 0.6
CTDP1-202ENST00000299543 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
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CTDP1-202ENST00000299543 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 CUL7Q14999 1698 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 UACAQ9BZF9 1416 aa18.73■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 NAIPQ13075 1403 aa18.73■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 HFM1A2PYH4 1435 aa18.73■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.72■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 CCER2I3L3R5 266 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-202ENST00000299543 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.7■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 FBLN2P98095 1184 aa18.69■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.69■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.68■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.65■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.65■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 GRIN2BQ13224 1484 aa18.65■□□□□ 0.58
CTDP1-202ENST00000299543 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.64■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.61■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.61■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.59■□□□□ 0.57
CTDP1-202ENST00000299543 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.58■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 SAMD9Q5K651 1589 aa18.56■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 CCDC184Q52MB2 194 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDP1-202ENST00000299543 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.53■□□□□ 0.56
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