RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271526.8

PRCC-201, Transcript of proline rich mitotic checkpoint control factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRCC, Length 2,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCC-201ENST00000271526 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.19■■□□□ 1.62
PRCC-201ENST00000271526 TOPBP1Q92547 1522 aa25.18■■□□□ 1.62
PRCC-201ENST00000271526 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.17■■□□□ 1.62
PRCC-201ENST00000271526 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PRCC-201ENST00000271526 MAPKBP1O60336 1514 aa25.15■■□□□ 1.62
PRCC-201ENST00000271526 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.12■■□□□ 1.61
PRCC-201ENST00000271526 CUL7Q14999 1698 aa25.12■■□□□ 1.61
PRCC-201ENST00000271526 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.11■■□□□ 1.61
PRCC-201ENST00000271526 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.611e-6■■■■□ 23.7
PRCC-201ENST00000271526 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.09■■□□□ 1.61
PRCC-201ENST00000271526 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.07■■□□□ 1.6
PRCC-201ENST00000271526 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.06■■□□□ 1.6
PRCC-201ENST00000271526 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PRCC-201ENST00000271526 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.03■■□□□ 1.6
PRCC-201ENST00000271526 WDR97A6NE52 1622 aa25.03■■□□□ 1.6
PRCC-201ENST00000271526 NESP48681 1621 aa25.02■■□□□ 1.6
PRCC-201ENST00000271526 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.02■■□□□ 1.6
PRCC-201ENST00000271526 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.02■■□□□ 1.6
PRCC-201ENST00000271526 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
PRCC-201ENST00000271526 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.99■■□□□ 1.59
PRCC-201ENST00000271526 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.98■■□□□ 1.59
PRCC-201ENST00000271526 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PRCC-201ENST00000271526 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.94■■□□□ 1.58
PRCC-201ENST00000271526 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.93■■□□□ 1.58
PRCC-201ENST00000271526 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.93■■□□□ 1.58
PRCC-201ENST00000271526 FMN1Q68DA7 1419 aa24.9■■□□□ 1.58
PRCC-201ENST00000271526 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.87■■□□□ 1.57
PRCC-201ENST00000271526 SAMD9Q5K651 1589 aa24.87■■□□□ 1.57
PRCC-201ENST00000271526 ITGAEP38570 1179 aa24.86■■□□□ 1.57
PRCC-201ENST00000271526 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.86■■□□□ 1.57
PRCC-201ENST00000271526 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.85■■□□□ 1.57
PRCC-201ENST00000271526 KCNH8Q96L42 1107 aa24.83■■□□□ 1.57
PRCC-201ENST00000271526 P3H3Q8IVL6 736 aa24.82■■□□□ 1.56
PRCC-201ENST00000271526 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.81■■□□□ 1.56
PRCC-201ENST00000271526 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PRCC-201ENST00000271526 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PRCC-201ENST00000271526 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.74■■□□□ 1.55
PRCC-201ENST00000271526 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PRCC-201ENST00000271526 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PRCC-201ENST00000271526 GRIN2BQ13224 1484 aa24.73■■□□□ 1.55
PRCC-201ENST00000271526 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PRCC-201ENST00000271526 CCER2I3L3R5 266 aa24.7■■□□□ 1.54
PRCC-201ENST00000271526 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.7■■□□□ 1.54
PRCC-201ENST00000271526 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.7■■□□□ 1.54
PRCC-201ENST00000271526 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PRCC-201ENST00000271526 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.68■■□□□ 1.54
PRCC-201ENST00000271526 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.67■■□□□ 1.54
PRCC-201ENST00000271526 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PRCC-201ENST00000271526 ARHGEF11O15085 1522 aa24.63■■□□□ 1.53
PRCC-201ENST00000271526 HFM1A2PYH4 1435 aa24.63■■□□□ 1.53
PRCC-201ENST00000271526 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.62■■□□□ 1.53
PRCC-201ENST00000271526 FKBP8Q14318 412 aa24.61■■□□□ 1.53
PRCC-201ENST00000271526 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.61■■□□□ 1.53
PRCC-201ENST00000271526 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.6■■□□□ 1.53
PRCC-201ENST00000271526 NCOA2Q15596 1464 aa24.6■■□□□ 1.53
PRCC-201ENST00000271526 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PRCC-201ENST00000271526 PTPRKQ15262 1439 aa24.58■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.56■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.56■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 UACAQ9BZF9 1416 aa24.56■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.55■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.55■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 PBRM1Q86U86 1689 aa24.53■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 ANP32CO43423 234 aa24.53■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 BCANQ96GW7 911 aa24.52■■□□□ 1.52
PRCC-201ENST00000271526 NAIPQ13075 1403 aa24.51■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 NEFLP07196 543 aa24.5■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 ADAMTS12P58397 1594 aa24.5■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.49■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 IQGAP2Q13576 1575 aa24.48■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 HECW1Q76N89 1606 aa24.47■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 TONSLQ96HA7 1378 aa24.46■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.46■■□□□ 1.51
PRCC-201ENST00000271526 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.45■■□□□ 1.5
PRCC-201ENST00000271526 AKNAQ7Z591 1439 aa24.44■■□□□ 1.5
PRCC-201ENST00000271526 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PRCC-201ENST00000271526 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PRCC-201ENST00000271526 MIA2Q96PC5 1412 aa24.4■■□□□ 1.5
PRCC-201ENST00000271526 TRIM52Q96A61 297 aa24.4■■□□□ 1.5
PRCC-201ENST00000271526 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PRCC-201ENST00000271526 WDR62O43379 1518 aa24.37■■□□□ 1.49
PRCC-201ENST00000271526 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.37■■□□□ 1.49
PRCC-201ENST00000271526 IFT140Q96RY7 1462 aa24.36■■□□□ 1.49
PRCC-201ENST00000271526 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.3■■□□□ 1.48
PRCC-201ENST00000271526 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PRCC-201ENST00000271526 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PRCC-201ENST00000271526 DISP1Q96F81 1524 aa24.24■■□□□ 1.47
PRCC-201ENST00000271526 KIAA0556O60303 1618 aa24.23■■□□□ 1.47
PRCC-201ENST00000271526 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PRCC-201ENST00000271526 ROCK1Q13464 1354 aa24.21■■□□□ 1.47
PRCC-201ENST00000271526 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.17■■□□□ 1.46
PRCC-201ENST00000271526 KDM6BO15054 1643 aa24.16■■□□□ 1.46
PRCC-201ENST00000271526 GRIN2AQ12879 1464 aa24.16■■□□□ 1.46
PRCC-201ENST00000271526 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.16■■□□□ 1.46
PRCC-201ENST00000271526 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.16■■□□□ 1.46
PRCC-201ENST00000271526 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PRCC-201ENST00000271526 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
PRCC-201ENST00000271526 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.15■■□□□ 1.46
PRCC-201ENST00000271526 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms