RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268661.7

RPL3L-201, Transcript of ribosomal protein L3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPL3L, Length 2,182 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3L-201ENST00000268661 ITGAEP38570 1179 aa23.47■■□□□ 1.35
RPL3L-201ENST00000268661 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.46■■□□□ 1.35
RPL3L-201ENST00000268661 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.45■■□□□ 1.35
RPL3L-201ENST00000268661 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.43■■□□□ 1.34
RPL3L-201ENST00000268661 IGF1RP08069 1367 aa23.4■■□□□ 1.34
RPL3L-201ENST00000268661 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.39■■□□□ 1.33
RPL3L-201ENST00000268661 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.38■■□□□ 1.33
RPL3L-201ENST00000268661 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
RPL3L-201ENST00000268661 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RPL3L-201ENST00000268661 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.32■■□□□ 1.32
RPL3L-201ENST00000268661 FKBP8Q14318 412 aa23.31■■□□□ 1.32
RPL3L-201ENST00000268661 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.31■■□□□ 1.32
RPL3L-201ENST00000268661 CCER2I3L3R5 266 aa23.3■■□□□ 1.32
RPL3L-201ENST00000268661 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RPL3L-201ENST00000268661 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.3■■□□□ 1.32
RPL3L-201ENST00000268661 BCANQ96GW7 911 aa23.27■■□□□ 1.32
RPL3L-201ENST00000268661 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
RPL3L-201ENST00000268661 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RPL3L-201ENST00000268661 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.2■■□□□ 1.3
RPL3L-201ENST00000268661 NEFLP07196 543 aa23.19■■□□□ 1.3
RPL3L-201ENST00000268661 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.19■■□□□ 1.3
RPL3L-201ENST00000268661 ANP32CO43423 234 aa23.17■■□□□ 1.3
RPL3L-201ENST00000268661 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
RPL3L-201ENST00000268661 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.15■■□□□ 1.3
RPL3L-201ENST00000268661 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RPL3L-201ENST00000268661 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.13■■□□□ 1.29
RPL3L-201ENST00000268661 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.1■■□□□ 1.29
RPL3L-201ENST00000268661 TRIM52Q96A61 297 aa23.1■■□□□ 1.29
RPL3L-201ENST00000268661 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RPL3L-201ENST00000268661 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.07■■□□□ 1.28
RPL3L-201ENST00000268661 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.06■■□□□ 1.28
RPL3L-201ENST00000268661 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.06■■□□□ 1.28
RPL3L-201ENST00000268661 TONSLQ96HA7 1378 aa23.05■■□□□ 1.28
RPL3L-201ENST00000268661 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.04■■□□□ 1.28
RPL3L-201ENST00000268661 UACAQ9BZF9 1416 aa23.04■■□□□ 1.28
RPL3L-201ENST00000268661 HFM1A2PYH4 1435 aa23.04■■□□□ 1.28
RPL3L-201ENST00000268661 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.03■■□□□ 1.28
RPL3L-201ENST00000268661 P3H3Q8IVL6 736 aa23.01■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 CUL7Q14999 1698 aa23■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.99■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.98■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.97■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 PTPRKQ15262 1439 aa22.96■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 FMN1Q68DA7 1419 aa22.96■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 BCL11AQ9H165 835 aa22.96■■□□□ 1.27
RPL3L-201ENST00000268661 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.93■■□□□ 1.26
RPL3L-201ENST00000268661 NAIPQ13075 1403 aa22.92■■□□□ 1.26
RPL3L-201ENST00000268661 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.92■■□□□ 1.26
RPL3L-201ENST00000268661 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.89■■□□□ 1.26
RPL3L-201ENST00000268661 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.87■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 SAMD9Q5K651 1589 aa22.87■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.87■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.86■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.86■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 MSH5O43196 834 aa22.86■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 NCOA2Q15596 1464 aa22.84■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 TOPBP1Q92547 1522 aa22.83■■□□□ 1.25
RPL3L-201ENST00000268661 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.82■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 HECW1Q76N89 1606 aa22.81■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 GRIN2BQ13224 1484 aa22.81■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.81■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.8■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.79■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 ARHGEF11O15085 1522 aa22.79■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.78■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 NESP48681 1621 aa22.77■■□□□ 1.24
RPL3L-201ENST00000268661 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RPL3L-201ENST00000268661 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.75■■□□□ 1.23
RPL3L-201ENST00000268661 ERCC6Q03468 1493 aa22.74■■□□□ 1.23
RPL3L-201ENST00000268661 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RPL3L-201ENST00000268661 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.73■■□□□ 1.23
RPL3L-201ENST00000268661 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RPL3L-201ENST00000268661 AKNAQ7Z591 1439 aa22.72■■□□□ 1.23
RPL3L-201ENST00000268661 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RPL3L-201ENST00000268661 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.68■■□□□ 1.22
RPL3L-201ENST00000268661 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.68■■□□□ 1.22
RPL3L-201ENST00000268661 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.67■■□□□ 1.22
RPL3L-201ENST00000268661 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
RPL3L-201ENST00000268661 NCOA1Q15788 1441 aa22.65■■□□□ 1.22
RPL3L-201ENST00000268661 KDM6BO15054 1643 aa22.64■■□□□ 1.22
RPL3L-201ENST00000268661 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RPL3L-201ENST00000268661 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.62■■□□□ 1.21
RPL3L-201ENST00000268661 CCDC184Q52MB2 194 aa22.61■■□□□ 1.21
RPL3L-201ENST00000268661 CCDC7Q96M83 1385 aa22.6■■□□□ 1.21
RPL3L-201ENST00000268661 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RPL3L-201ENST00000268661 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.59■■□□□ 1.21
RPL3L-201ENST00000268661 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.59■■□□□ 1.21
RPL3L-201ENST00000268661 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.57■■□□□ 1.2
RPL3L-201ENST00000268661 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
RPL3L-201ENST00000268661 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.55■■□□□ 1.2
RPL3L-201ENST00000268661 MIA2Q96PC5 1412 aa22.55■■□□□ 1.2
RPL3L-201ENST00000268661 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
RPL3L-201ENST00000268661 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms