RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264546.10

FRMD4A-201, Transcript of FERM domain containing 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene FRMD4A, Length 2,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4A-201ENST00000264546 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
FRMD4A-201ENST00000264546 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.6■■□□□ 1.21
FRMD4A-201ENST00000264546 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FRMD4A-201ENST00000264546 GRIN2BQ13224 1484 aa22.59■■□□□ 1.21
FRMD4A-201ENST00000264546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.57■■□□□ 1.2
FRMD4A-201ENST00000264546 PBRM1Q86U86 1689 aa22.57■■□□□ 1.2
FRMD4A-201ENST00000264546 FBLN2P98095 1184 aa22.56■■□□□ 1.2
FRMD4A-201ENST00000264546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.55■■□□□ 1.2
FRMD4A-201ENST00000264546 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.55■■□□□ 1.2
FRMD4A-201ENST00000264546 PRXQ9BXM0 1461 aa22.55■■□□□ 1.2
FRMD4A-201ENST00000264546 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
FRMD4A-201ENST00000264546 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.54■■□□□ 1.2
FRMD4A-201ENST00000264546 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
FRMD4A-201ENST00000264546 GOLGA3Q08378 1498 aa22.49■■□□□ 1.19
FRMD4A-201ENST00000264546 KIF21BO75037 1637 aa22.48■■□□□ 1.19
FRMD4A-201ENST00000264546 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FRMD4A-201ENST00000264546 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
FRMD4A-201ENST00000264546 CUL7Q14999 1698 aa22.46■■□□□ 1.19
FRMD4A-201ENST00000264546 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.45■■□□□ 1.18
FRMD4A-201ENST00000264546 ADAMTS12P58397 1594 aa22.43■■□□□ 1.18
FRMD4A-201ENST00000264546 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
FRMD4A-201ENST00000264546 APLP2Q06481 763 aa22.41■■□□□ 1.18
FRMD4A-201ENST00000264546 MIER1Q8N108 512 aa22.41■■□□□ 1.18
FRMD4A-201ENST00000264546 SYNJ2O15056 1496 aa22.36■■□□□ 1.17
FRMD4A-201ENST00000264546 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.34■■□□□ 1.17
FRMD4A-201ENST00000264546 GRIN2AQ12879 1464 aa22.32■■□□□ 1.16
FRMD4A-201ENST00000264546 CHD1O14646 1710 aa22.24■■□□□ 1.15
FRMD4A-201ENST00000264546 CEP162Q5TB80 1403 aa22.24■■□□□ 1.15
FRMD4A-201ENST00000264546 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.22■■□□□ 1.15
FRMD4A-201ENST00000264546 P3H3Q8IVL6 736 aa22.2■■□□□ 1.14
FRMD4A-201ENST00000264546 CEP170Q5SW79 1584 aa22.19■■□□□ 1.14
FRMD4A-201ENST00000264546 CLIP1P30622 1438 aa22.17■■□□□ 1.14
FRMD4A-201ENST00000264546 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.17■■□□□ 1.14
FRMD4A-201ENST00000264546 NUP160Q12769 1436 aa22.14■■□□□ 1.13
FRMD4A-201ENST00000264546 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.12■■□□□ 1.13
FRMD4A-201ENST00000264546 IQGAP2Q13576 1575 aa22.1■■□□□ 1.13
FRMD4A-201ENST00000264546 JPH4Q96JJ6 628 aa22.09■■□□□ 1.13
FRMD4A-201ENST00000264546 OSCARQ8IYS5 282 aa22.08■■□□□ 1.13
FRMD4A-201ENST00000264546 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.05■■□□□ 1.12
FRMD4A-201ENST00000264546 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.01■■□□□ 1.11
FRMD4A-201ENST00000264546 ARAP1Q96P48 1450 aa22■■□□□ 1.11
FRMD4A-201ENST00000264546 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FRMD4A-201ENST00000264546 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.95■■□□□ 1.1
FRMD4A-201ENST00000264546 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FRMD4A-201ENST00000264546 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
FRMD4A-201ENST00000264546 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.94■■□□□ 1.1
FRMD4A-201ENST00000264546 DISP1Q96F81 1524 aa21.93■■□□□ 1.1
FRMD4A-201ENST00000264546 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.92■■□□□ 1.1
FRMD4A-201ENST00000264546 SAMD9Q5K651 1589 aa21.91■■□□□ 1.1
FRMD4A-201ENST00000264546 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.89■■□□□ 1.1
FRMD4A-201ENST00000264546 KIAA0556O60303 1618 aa21.88■■□□□ 1.09
FRMD4A-201ENST00000264546 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.88■■□□□ 1.09
FRMD4A-201ENST00000264546 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.87■■□□□ 1.09
FRMD4A-201ENST00000264546 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.86■■□□□ 1.09
FRMD4A-201ENST00000264546 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.85■■□□□ 1.09
FRMD4A-201ENST00000264546 ARID3CA6NKF2 412 aa21.84■■□□□ 1.09
FRMD4A-201ENST00000264546 SHROOM2Q13796 1616 aa21.84■■□□□ 1.09
FRMD4A-201ENST00000264546 FMN1Q68DA7 1419 aa21.79■■□□□ 1.08
FRMD4A-201ENST00000264546 PTPRGP23470 1445 aa21.77■■□□□ 1.08
FRMD4A-201ENST00000264546 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
FRMD4A-201ENST00000264546 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.73■■□□□ 1.07
FRMD4A-201ENST00000264546 MSH5O43196 834 aa21.73■■□□□ 1.07
FRMD4A-201ENST00000264546 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.69■■□□□ 1.06
FRMD4A-201ENST00000264546 NEFLP07196 543 aa21.68■■□□□ 1.06
FRMD4A-201ENST00000264546 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
FRMD4A-201ENST00000264546 FKBP8Q14318 412 aa21.67■■□□□ 1.06
FRMD4A-201ENST00000264546 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
FRMD4A-201ENST00000264546 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.65■■□□□ 1.06
FRMD4A-201ENST00000264546 ARHGEF11O15085 1522 aa21.65■■□□□ 1.06
FRMD4A-201ENST00000264546 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.62■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.62■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 UACAQ9BZF9 1416 aa21.6■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.59■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 BCANQ96GW7 911 aa21.58■■□□□ 1.05
FRMD4A-201ENST00000264546 HECW1Q76N89 1606 aa21.58■■□□□ 1.04
FRMD4A-201ENST00000264546 ABCA8O94911 1581 aa21.57■■□□□ 1.04
FRMD4A-201ENST00000264546 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.57■■□□□ 1.04
FRMD4A-201ENST00000264546 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.57■■□□□ 1.04
FRMD4A-201ENST00000264546 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.57■■□□□ 1.04
FRMD4A-201ENST00000264546 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.57■■□□□ 1.04
FRMD4A-201ENST00000264546 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
FRMD4A-201ENST00000264546 TIAM1Q13009 1591 aa21.54■■□□□ 1.04
FRMD4A-201ENST00000264546 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.5■■□□□ 1.03
FRMD4A-201ENST00000264546 ABCC2Q92887 1545 aa21.5■■□□□ 1.03
FRMD4A-201ENST00000264546 ATP10BO94823 1461 aa21.49■■□□□ 1.03
FRMD4A-201ENST00000264546 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.49■■□□□ 1.03
FRMD4A-201ENST00000264546 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.47■■□□□ 1.03
FRMD4A-201ENST00000264546 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.46■■□□□ 1.03
FRMD4A-201ENST00000264546 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.46■■□□□ 1.03
FRMD4A-201ENST00000264546 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FRMD4A-201ENST00000264546 MAP3K1Q13233 1512 aa21.44■■□□□ 1.02
FRMD4A-201ENST00000264546 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.44■■□□□ 1.02
FRMD4A-201ENST00000264546 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.43■■□□□ 1.02
FRMD4A-201ENST00000264546 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
FRMD4A-201ENST00000264546 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.41■■□□□ 1.02
FRMD4A-201ENST00000264546 KCNH8Q96L42 1107 aa21.4■■□□□ 1.02
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