RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 IGF1RP08069 1367 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRH-201ENST00000263434 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRH-201ENST00000263434 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRH-201ENST00000263434 MAPKBP1O60336 1514 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRH-201ENST00000263434 WDR97A6NE52 1622 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRH-201ENST00000263434 NCAPD3P42695 1498 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRH-201ENST00000263434 CFTRP13569 1480 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRH-201ENST00000263434 NEFLP07196 543 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRH-201ENST00000263434 TIAM1Q13009 1591 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRH-201ENST00000263434 ANP32CO43423 234 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRH-201ENST00000263434 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRH-201ENST00000263434 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRH-201ENST00000263434 HMGXB3Q12766 1538 aa21.69■■□□□ 1.06
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PTPRH-201ENST00000263434 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRH-201ENST00000263434 TONSLQ96HA7 1378 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRH-201ENST00000263434 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRH-201ENST00000263434 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRH-201ENST00000263434 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRH-201ENST00000263434 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRH-201ENST00000263434 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRH-201ENST00000263434 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRH-201ENST00000263434 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRH-201ENST00000263434 MAP3K1Q13233 1512 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRH-201ENST00000263434 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRH-201ENST00000263434 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRH-201ENST00000263434 FOXD1Q16676 465 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRH-201ENST00000263434 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRH-201ENST00000263434 NESP48681 1621 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRH-201ENST00000263434 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRH-201ENST00000263434 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRH-201ENST00000263434 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRH-201ENST00000263434 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRH-201ENST00000263434 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 33.5
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PTPRH-201ENST00000263434 UACAQ9BZF9 1416 aa21.31■■□□□ 1
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PTPRH-201ENST00000263434 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.23■□□□□ 0.99
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PTPRH-201ENST00000263434 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.22■□□□□ 0.99
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PTPRH-201ENST00000263434 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRH-201ENST00000263434 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRH-201ENST00000263434 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.04■□□□□ 0.96
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PTPRH-201ENST00000263434 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRH-201ENST00000263434 KIF7Q2M1P5 1343 aa21■□□□□ 0.95
PTPRH-201ENST00000263434 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.98■□□□□ 0.95
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