RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256474.2

VHL-201, Transcript of von Hippel-Lindau tumor suppressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VHL, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHL-201ENST00000256474 NCAPD3P42695 1498 aa19.18■□□□□ 0.66
VHL-201ENST00000256474 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.18■□□□□ 0.66
VHL-201ENST00000256474 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.18■□□□□ 0.66
VHL-201ENST00000256474 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
VHL-201ENST00000256474 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.15■□□□□ 0.66
VHL-201ENST00000256474 NEFLP07196 543 aa19.14■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 CFTRP13569 1480 aa19.14■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 ANP32CO43423 234 aa19.13■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.11■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.11■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.11■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.11■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.1■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 TONSLQ96HA7 1378 aa19.08■□□□□ 0.65
VHL-201ENST00000256474 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.07■□□□□ 0.64
VHL-201ENST00000256474 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.05■□□□□ 0.64
VHL-201ENST00000256474 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
VHL-201ENST00000256474 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.04■□□□□ 0.64
VHL-201ENST00000256474 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.03■□□□□ 0.64
VHL-201ENST00000256474 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 WDR97A6NE52 1622 aa19■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 HMGXB3Q12766 1538 aa19■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 FOXD1Q16676 465 aa18.99■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.99■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 NESP48681 1621 aa18.96■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 TIAM1Q13009 1591 aa18.96■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 MYT1Q01538 1121 aa18.96■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 MAPKBP1O60336 1514 aa18.96■□□□□ 0.63
VHL-201ENST00000256474 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.95■□□□□ 0.62
VHL-201ENST00000256474 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.95■□□□□ 0.62
VHL-201ENST00000256474 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
VHL-201ENST00000256474 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.87■□□□□ 0.61
VHL-201ENST00000256474 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
VHL-201ENST00000256474 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
VHL-201ENST00000256474 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
VHL-201ENST00000256474 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
VHL-201ENST00000256474 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.79■□□□□ 0.6
VHL-201ENST00000256474 FBLN2P98095 1184 aa18.79■□□□□ 0.6
VHL-201ENST00000256474 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.79■□□□□ 0.6
VHL-201ENST00000256474 PTPRKQ15262 1439 aa18.77■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.76■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 FMN1Q68DA7 1419 aa18.75■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.74■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 TOPBP1Q92547 1522 aa18.74■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.73■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 CCER2I3L3R5 266 aa18.73■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 CCDC184Q52MB2 194 aa18.73■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.72■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 MRS2Q9HD23 443 aa18.71■□□□□ 0.59
VHL-201ENST00000256474 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.7■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.69■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.68■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 29
VHL-201ENST00000256474 NCOA2Q15596 1464 aa18.68■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.68■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.67■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 MAP3K1Q13233 1512 aa18.64■□□□□ 0.58
VHL-201ENST00000256474 UACAQ9BZF9 1416 aa18.64■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.63■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 NAIPQ13075 1403 aa18.63■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.63■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.62■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.62■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.6■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.6■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 HFM1A2PYH4 1435 aa18.59■□□□□ 0.57
VHL-201ENST00000256474 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
VHL-201ENST00000256474 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.56■□□□□ 0.56
VHL-201ENST00000256474 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.53■□□□□ 0.56
VHL-201ENST00000256474 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.53■□□□□ 0.56
VHL-201ENST00000256474 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.52■□□□□ 0.56
VHL-201ENST00000256474 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
VHL-201ENST00000256474 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.52■□□□□ 0.55
VHL-201ENST00000256474 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
VHL-201ENST00000256474 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.5■□□□□ 0.55
VHL-201ENST00000256474 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
VHL-201ENST00000256474 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
VHL-201ENST00000256474 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 PKD2Q13563 968 aa18.44■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 PRDM2Q13029 1718 aa18.43■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.43■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.42■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 GRIN2BQ13224 1484 aa18.42■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 MSH5O43196 834 aa18.41■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 CCDC7Q96M83 1385 aa18.41■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 RGL3Q3MIN7 710 aa18.41■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 TMC1Q8TDI8 760 aa18.4■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 CUL7Q14999 1698 aa18.4■□□□□ 0.54
VHL-201ENST00000256474 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.549e-12■□□□□ 9.2
VHL-201ENST00000256474 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.4 ms