RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233084.7

DDX1-201, Transcript of DEAD-box helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX1, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1-201ENST00000233084 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.2■■□□□ 1.3
DDX1-201ENST00000233084 GOLGA3Q08378 1498 aa23.2■■□□□ 1.3
DDX1-201ENST00000233084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
DDX1-201ENST00000233084 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.19■■□□□ 1.3
DDX1-201ENST00000233084 PBRM1Q86U86 1689 aa23.17■■□□□ 1.3
DDX1-201ENST00000233084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.16■■□□□ 1.3
DDX1-201ENST00000233084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.37e-7■■■■□ 24.5
DDX1-201ENST00000233084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
DDX1-201ENST00000233084 CUL7Q14999 1698 aa23.13■■□□□ 1.29
DDX1-201ENST00000233084 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.09■■□□□ 1.29
DDX1-201ENST00000233084 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.06■■□□□ 1.28
DDX1-201ENST00000233084 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
DDX1-201ENST00000233084 GRIN2BQ13224 1484 aa23.05■■□□□ 1.28
DDX1-201ENST00000233084 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
DDX1-201ENST00000233084 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.01■■□□□ 1.27
DDX1-201ENST00000233084 ADAMTS12P58397 1594 aa23■■□□□ 1.27
DDX1-201ENST00000233084 CEP162Q5TB80 1403 aa22.95■■□□□ 1.27
DDX1-201ENST00000233084 BCANQ96GW7 911 aa22.95■■□□□ 1.26
DDX1-201ENST00000233084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.94■■□□□ 1.26
DDX1-201ENST00000233084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.93■■□□□ 1.26
DDX1-201ENST00000233084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
DDX1-201ENST00000233084 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.88■■□□□ 1.25
DDX1-201ENST00000233084 CLIP1P30622 1438 aa22.81■■□□□ 1.24
DDX1-201ENST00000233084 SYNJ2O15056 1496 aa22.81■■□□□ 1.24
DDX1-201ENST00000233084 GRIN2AQ12879 1464 aa22.79■■□□□ 1.24
DDX1-201ENST00000233084 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
DDX1-201ENST00000233084 CHD1O14646 1710 aa22.71■■□□□ 1.23
DDX1-201ENST00000233084 FKBP8Q14318 412 aa22.71■■□□□ 1.23
DDX1-201ENST00000233084 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 KCNH8Q96L42 1107 aa22.7■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.69■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 CEP170Q5SW79 1584 aa22.69■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 IQGAP2Q13576 1575 aa22.67■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 ARAP1Q96P48 1450 aa22.67■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 FBLN2P98095 1184 aa22.66■■□□□ 1.22
DDX1-201ENST00000233084 NUP160Q12769 1436 aa22.64■■□□□ 1.21
DDX1-201ENST00000233084 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.62■■□□□ 1.21
DDX1-201ENST00000233084 SAMD9Q5K651 1589 aa22.61■■□□□ 1.21
DDX1-201ENST00000233084 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.61■■□□□ 1.21
DDX1-201ENST00000233084 ITGAEP38570 1179 aa22.59■■□□□ 1.21
DDX1-201ENST00000233084 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.58■■□□□ 1.21
DDX1-201ENST00000233084 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.54■■□□□ 1.2
DDX1-201ENST00000233084 MSH5O43196 834 aa22.53■■□□□ 1.2
DDX1-201ENST00000233084 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.51■■□□□ 1.19
DDX1-201ENST00000233084 P3H3Q8IVL6 736 aa22.5■■□□□ 1.19
DDX1-201ENST00000233084 DISP1Q96F81 1524 aa22.46■■□□□ 1.19
DDX1-201ENST00000233084 NEFLP07196 543 aa22.45■■□□□ 1.19
DDX1-201ENST00000233084 APLP2Q06481 763 aa22.45■■□□□ 1.19
DDX1-201ENST00000233084 KIAA0556O60303 1618 aa22.45■■□□□ 1.18
DDX1-201ENST00000233084 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
DDX1-201ENST00000233084 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.41■■□□□ 1.18
DDX1-201ENST00000233084 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
DDX1-201ENST00000233084 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.4■■□□□ 1.18
DDX1-201ENST00000233084 SHROOM2Q13796 1616 aa22.4■■□□□ 1.18
DDX1-201ENST00000233084 JPH4Q96JJ6 628 aa22.39■■□□□ 1.18
DDX1-201ENST00000233084 FMN1Q68DA7 1419 aa22.36■■□□□ 1.17
DDX1-201ENST00000233084 TRIM52Q96A61 297 aa22.33■■□□□ 1.16
DDX1-201ENST00000233084 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.32■■□□□ 1.16
DDX1-201ENST00000233084 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.32■■□□□ 1.16
DDX1-201ENST00000233084 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.31■■□□□ 1.16
DDX1-201ENST00000233084 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
DDX1-201ENST00000233084 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.3■■□□□ 1.16
DDX1-201ENST00000233084 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
DDX1-201ENST00000233084 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.26■■□□□ 1.15
DDX1-201ENST00000233084 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.26■■□□□ 1.15
DDX1-201ENST00000233084 TIAM1Q13009 1591 aa22.25■■□□□ 1.15
DDX1-201ENST00000233084 MAP3K1Q13233 1512 aa22.23■■□□□ 1.15
DDX1-201ENST00000233084 HECW1Q76N89 1606 aa22.21■■□□□ 1.15
DDX1-201ENST00000233084 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
DDX1-201ENST00000233084 OSCARQ8IYS5 282 aa22.2■■□□□ 1.14
DDX1-201ENST00000233084 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.2■■□□□ 1.14
DDX1-201ENST00000233084 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
DDX1-201ENST00000233084 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.18■■□□□ 1.14
DDX1-201ENST00000233084 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
DDX1-201ENST00000233084 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.16■■□□□ 1.14
DDX1-201ENST00000233084 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
DDX1-201ENST00000233084 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 ABCA8O94911 1581 aa22.14■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.12■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 PTPRGP23470 1445 aa22.12■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.11■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
DDX1-201ENST00000233084 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.05■■□□□ 1.12
DDX1-201ENST00000233084 ARID3CA6NKF2 412 aa22.03■■□□□ 1.12
DDX1-201ENST00000233084 NBR1Q14596 966 aa22.02■■□□□ 1.12
DDX1-201ENST00000233084 MYT1LQ9UL68 1186 aa22■■□□□ 1.11
DDX1-201ENST00000233084 UACAQ9BZF9 1416 aa22■■□□□ 1.11
DDX1-201ENST00000233084 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22■■□□□ 1.11
DDX1-201ENST00000233084 ANP32CO43423 234 aa21.99■■□□□ 1.11
DDX1-201ENST00000233084 ABCC2Q92887 1545 aa21.98■■□□□ 1.11
DDX1-201ENST00000233084 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.98■■□□□ 1.11
DDX1-201ENST00000233084 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
DDX1-201ENST00000233084 ATP10BO94823 1461 aa21.96■■□□□ 1.11
DDX1-201ENST00000233084 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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