RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
PANX1-201ENST00000227638 TOPBP1Q92547 1522 aa26.45■■□□□ 1.83
PANX1-201ENST00000227638 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.45■■□□□ 1.82
PANX1-201ENST00000227638 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PANX1-201ENST00000227638 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PANX1-201ENST00000227638 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.41■■□□□ 1.82
PANX1-201ENST00000227638 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.4■■□□□ 1.82
PANX1-201ENST00000227638 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.38■■□□□ 1.81
PANX1-201ENST00000227638 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PANX1-201ENST00000227638 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PANX1-201ENST00000227638 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.31■■□□□ 1.8
PANX1-201ENST00000227638 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.31■■□□□ 1.8
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PANX1-201ENST00000227638 TIAM1Q13009 1591 aa26.23■■□□□ 1.79
PANX1-201ENST00000227638 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PANX1-201ENST00000227638 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.2■■□□□ 1.79
PANX1-201ENST00000227638 MYT1Q01538 1121 aa26.2■■□□□ 1.79
PANX1-201ENST00000227638 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.2■■□□□ 1.78
PANX1-201ENST00000227638 MAPKBP1O60336 1514 aa26.19■■□□□ 1.78
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PANX1-201ENST00000227638 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.15■■□□□ 1.78
PANX1-201ENST00000227638 ARID3CA6NKF2 412 aa26.14■■□□□ 1.78
PANX1-201ENST00000227638 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.13■■□□□ 1.77
PANX1-201ENST00000227638 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.13■■□□□ 1.77
PANX1-201ENST00000227638 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.12■■□□□ 1.77
PANX1-201ENST00000227638 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.09■■□□□ 1.77
PANX1-201ENST00000227638 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PANX1-201ENST00000227638 WDR97A6NE52 1622 aa26.06■■□□□ 1.76
PANX1-201ENST00000227638 CUL7Q14999 1698 aa26.06■■□□□ 1.76
PANX1-201ENST00000227638 BCANQ96GW7 911 aa26.03■■□□□ 1.76
PANX1-201ENST00000227638 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.01■■□□□ 1.75
PANX1-201ENST00000227638 MAP3K1Q13233 1512 aa26.01■■□□□ 1.75
PANX1-201ENST00000227638 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26■■□□□ 1.75
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PANX1-201ENST00000227638 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.96■■□□□ 1.75
PANX1-201ENST00000227638 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.96■■□□□ 1.75
PANX1-201ENST00000227638 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.96■■□□□ 1.75
PANX1-201ENST00000227638 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.94■■□□□ 1.74
PANX1-201ENST00000227638 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.94■■□□□ 1.74
PANX1-201ENST00000227638 PTPRKQ15262 1439 aa25.92■■□□□ 1.74
PANX1-201ENST00000227638 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.91■■□□□ 1.74
PANX1-201ENST00000227638 TRIM52Q96A61 297 aa25.9■■□□□ 1.74
PANX1-201ENST00000227638 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.89■■□□□ 1.73
PANX1-201ENST00000227638 FMN1Q68DA7 1419 aa25.88■■□□□ 1.73
PANX1-201ENST00000227638 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PANX1-201ENST00000227638 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PANX1-201ENST00000227638 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.87■■□□□ 1.73
PANX1-201ENST00000227638 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.81■■□□□ 1.72
PANX1-201ENST00000227638 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.8■■□□□ 1.72
PANX1-201ENST00000227638 SAMD9Q5K651 1589 aa25.78■■□□□ 1.72
PANX1-201ENST00000227638 FOXD1Q16676 465 aa25.78■■□□□ 1.72
PANX1-201ENST00000227638 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PANX1-201ENST00000227638 TONSLQ96HA7 1378 aa25.75■■□□□ 1.71
PANX1-201ENST00000227638 FKBP8Q14318 412 aa25.74■■□□□ 1.71
PANX1-201ENST00000227638 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.74■■□□□ 1.71
PANX1-201ENST00000227638 PBRM1Q86U86 1689 aa25.73■■□□□ 1.71
PANX1-201ENST00000227638 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.72■■□□□ 1.71
PANX1-201ENST00000227638 GRIN2BQ13224 1484 aa25.72■■□□□ 1.71
PANX1-201ENST00000227638 NCOA2Q15596 1464 aa25.7■■□□□ 1.7
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PANX1-201ENST00000227638 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.66■■□□□ 1.7
PANX1-201ENST00000227638 ANP32CO43423 234 aa25.64■■□□□ 1.7
PANX1-201ENST00000227638 ADAMTS12P58397 1594 aa25.63■■□□□ 1.69
PANX1-201ENST00000227638 NAIPQ13075 1403 aa25.63■■□□□ 1.69
PANX1-201ENST00000227638 IQGAP2Q13576 1575 aa25.61■■□□□ 1.69
PANX1-201ENST00000227638 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PANX1-201ENST00000227638 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.6■■□□□ 1.69
PANX1-201ENST00000227638 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PANX1-201ENST00000227638 FBLN2P98095 1184 aa25.59■■□□□ 1.69
PANX1-201ENST00000227638 HFM1A2PYH4 1435 aa25.57■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 UACAQ9BZF9 1416 aa25.55■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 ERCC6Q03468 1493 aa25.55■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.55■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.52■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.52■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 IFT140Q96RY7 1462 aa25.52■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
PANX1-201ENST00000227638 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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PANX1-201ENST00000227638 CCDC184Q52MB2 194 aa25.48■■□□□ 1.67
PANX1-201ENST00000227638 KDM6BO15054 1643 aa25.48■■□□□ 1.67
PANX1-201ENST00000227638 WDR62O43379 1518 aa25.48■■□□□ 1.67
PANX1-201ENST00000227638 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PANX1-201ENST00000227638 HECW1Q76N89 1606 aa25.45■■□□□ 1.67
PANX1-201ENST00000227638 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
PANX1-201ENST00000227638 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.45■■□□□ 1.67
PANX1-201ENST00000227638 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.45■■□□□ 1.66
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PANX1-201ENST00000227638 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.44■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF11O15085 1522 aa25.4■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 DISP1Q96F81 1524 aa25.4■■□□□ 1.66
PANX1-201ENST00000227638 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.39■■□□□ 1.66
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