RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa38.81■■■■□ 3.8
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FAM149A-201ENST00000227065 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.51■■■■□ 3.76
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FAM149A-201ENST00000227065 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.4■■■■□ 3.74
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FAM149A-201ENST00000227065 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.33■■■■□ 3.73
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FAM149A-201ENST00000227065 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.19■■■■□ 3.7
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FAM149A-201ENST00000227065 TOPBP1Q92547 1522 aa38.18■■■■□ 3.7
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FAM149A-201ENST00000227065 CUL7Q14999 1698 aa38.09■■■■□ 3.69
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FAM149A-201ENST00000227065 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.07■■■■□ 3.68
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FAM149A-201ENST00000227065 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.74■■■■□ 3.63
FAM149A-201ENST00000227065 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.71■■■■□ 3.63
FAM149A-201ENST00000227065 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.7■■■■□ 3.63
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FAM149A-201ENST00000227065 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.66■■■■□ 3.62
FAM149A-201ENST00000227065 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
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FAM149A-201ENST00000227065 ARHGEF11O15085 1522 aa37.59■■■■□ 3.61
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FAM149A-201ENST00000227065 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.42■■■■□ 3.58
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FAM149A-201ENST00000227065 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.58
FAM149A-201ENST00000227065 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
FAM149A-201ENST00000227065 AKNAQ7Z591 1439 aa37.37■■■■□ 3.57
FAM149A-201ENST00000227065 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.37■■■■□ 3.57
FAM149A-201ENST00000227065 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.34■■■■□ 3.57
FAM149A-201ENST00000227065 MIA2Q96PC5 1412 aa37.32■■■■□ 3.56
FAM149A-201ENST00000227065 FAM9BQ8IZU0 186 aa37.31■■■■□ 3.56
FAM149A-201ENST00000227065 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
FAM149A-201ENST00000227065 IQGAP2Q13576 1575 aa37.27■■■■□ 3.56
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