RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa38.81■■■■□ 3.8
FAM149A-201ENST00000227065 PRDM2Q13029 1718 aa38.81■■■■□ 3.8
FAM149A-201ENST00000227065 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
FAM149A-201ENST00000227065 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.78■■■■□ 3.8
FAM149A-201ENST00000227065 P3H3Q8IVL6 736 aa38.78■■■■□ 3.8
FAM149A-201ENST00000227065 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.76■■■■□ 3.8
FAM149A-201ENST00000227065 SIN3AQ96ST3 1273 aa38.76■■■■□ 3.8
FAM149A-201ENST00000227065 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
FAM149A-201ENST00000227065 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
FAM149A-201ENST00000227065 BCANQ96GW7 911 aa38.69■■■■□ 3.78
FAM149A-201ENST00000227065 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.65■■■■□ 3.78
FAM149A-201ENST00000227065 WDR97A6NE52 1622 aa38.64■■■■□ 3.78
FAM149A-201ENST00000227065 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
FAM149A-201ENST00000227065 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
FAM149A-201ENST00000227065 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.53■■■■□ 3.76
FAM149A-201ENST00000227065 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.51■■■■□ 3.76
FAM149A-201ENST00000227065 FKBP8Q14318 412 aa38.5■■■■□ 3.75
FAM149A-201ENST00000227065 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
FAM149A-201ENST00000227065 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa38.4■■■■□ 3.74
FAM149A-201ENST00000227065 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.4■■■■□ 3.74
FAM149A-201ENST00000227065 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.4■■■■□ 3.74
FAM149A-201ENST00000227065 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.35■■■■□ 3.73
FAM149A-201ENST00000227065 TRIM52Q96A61 297 aa38.33■■■■□ 3.73
FAM149A-201ENST00000227065 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.33■■■■□ 3.73
FAM149A-201ENST00000227065 ANP32EQ9BTT0 268 aa38.32■■■■□ 3.72
FAM149A-201ENST00000227065 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.27■■■■□ 3.72
FAM149A-201ENST00000227065 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.26■■■■□ 3.72
FAM149A-201ENST00000227065 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.25■■■■□ 3.71
FAM149A-201ENST00000227065 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
FAM149A-201ENST00000227065 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.22■■■■□ 3.71
FAM149A-201ENST00000227065 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.22■■■■□ 3.71
FAM149A-201ENST00000227065 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.2■■■■□ 3.71
FAM149A-201ENST00000227065 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.19■■■■□ 3.7
FAM149A-201ENST00000227065 ANP32CO43423 234 aa38.18■■■■□ 3.7
FAM149A-201ENST00000227065 TOPBP1Q92547 1522 aa38.18■■■■□ 3.7
FAM149A-201ENST00000227065 NEFLP07196 543 aa38.16■■■■□ 3.7
FAM149A-201ENST00000227065 TONSLQ96HA7 1378 aa38.15■■■■□ 3.7
FAM149A-201ENST00000227065 CCER2I3L3R5 266 aa38.14■■■■□ 3.7
FAM149A-201ENST00000227065 FMN1Q68DA7 1419 aa38.13■■■■□ 3.69
FAM149A-201ENST00000227065 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.12■■■■□ 3.69
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.11■■■■□ 3.69
FAM149A-201ENST00000227065 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.11■■■■□ 3.69
FAM149A-201ENST00000227065 PTPRKQ15262 1439 aa38.1■■■■□ 3.69
FAM149A-201ENST00000227065 CUL7Q14999 1698 aa38.09■■■■□ 3.69
FAM149A-201ENST00000227065 NESP48681 1621 aa38.07■■■■□ 3.69
FAM149A-201ENST00000227065 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.07■■■■□ 3.68
FAM149A-201ENST00000227065 HFM1A2PYH4 1435 aa38.02■■■■□ 3.68
FAM149A-201ENST00000227065 UACAQ9BZF9 1416 aa38.01■■■■□ 3.68
FAM149A-201ENST00000227065 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
FAM149A-201ENST00000227065 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.96■■■■□ 3.67
FAM149A-201ENST00000227065 NAIPQ13075 1403 aa37.93■■■■□ 3.66
FAM149A-201ENST00000227065 NCOA2Q15596 1464 aa37.92■■■■□ 3.66
FAM149A-201ENST00000227065 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
FAM149A-201ENST00000227065 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.89■■■■□ 3.66
FAM149A-201ENST00000227065 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.89■■■■□ 3.66
FAM149A-201ENST00000227065 SAMD9Q5K651 1589 aa37.84■■■■□ 3.65
FAM149A-201ENST00000227065 GRIN2BQ13224 1484 aa37.83■■■■□ 3.65
FAM149A-201ENST00000227065 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.65
FAM149A-201ENST00000227065 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.78■■■■□ 3.64
FAM149A-201ENST00000227065 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
FAM149A-201ENST00000227065 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP37.76■■■■□ 3.64
FAM149A-201ENST00000227065 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.76■■■■□ 3.64
FAM149A-201ENST00000227065 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
FAM149A-201ENST00000227065 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.75■■■■□ 3.63
FAM149A-201ENST00000227065 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.74■■■■□ 3.63
FAM149A-201ENST00000227065 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.71■■■■□ 3.63
FAM149A-201ENST00000227065 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.7■■■■□ 3.63
FAM149A-201ENST00000227065 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.66■■■■□ 3.62
FAM149A-201ENST00000227065 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.66■■■■□ 3.62
FAM149A-201ENST00000227065 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
FAM149A-201ENST00000227065 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
FAM149A-201ENST00000227065 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.63■■■■□ 3.61
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGEF11O15085 1522 aa37.59■■■■□ 3.61
FAM149A-201ENST00000227065 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.58■■■■□ 3.61
FAM149A-201ENST00000227065 MSH5O43196 834 aa37.58■■■■□ 3.61
FAM149A-201ENST00000227065 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
FAM149A-201ENST00000227065 BCL11AQ9H165 835 aa37.52■■■■□ 3.6
FAM149A-201ENST00000227065 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.51■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 KDM6BO15054 1643 aa37.5■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.49■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 ARID3CA6NKF2 412 aa37.48■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC184Q52MB2 194 aa37.48■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 FOXD1Q16676 465 aa37.47■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.46■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 HECW1Q76N89 1606 aa37.45■■■■□ 3.59
FAM149A-201ENST00000227065 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.45■■■■□ 3.58
FAM149A-201ENST00000227065 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.42■■■■□ 3.58
FAM149A-201ENST00000227065 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.42■■■■□ 3.58
FAM149A-201ENST00000227065 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
FAM149A-201ENST00000227065 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
FAM149A-201ENST00000227065 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.58
FAM149A-201ENST00000227065 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
FAM149A-201ENST00000227065 AKNAQ7Z591 1439 aa37.37■■■■□ 3.57
FAM149A-201ENST00000227065 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.37■■■■□ 3.57
FAM149A-201ENST00000227065 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.34■■■■□ 3.57
FAM149A-201ENST00000227065 MIA2Q96PC5 1412 aa37.32■■■■□ 3.56
FAM149A-201ENST00000227065 FAM9BQ8IZU0 186 aa37.31■■■■□ 3.56
FAM149A-201ENST00000227065 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
FAM149A-201ENST00000227065 IQGAP2Q13576 1575 aa37.27■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms