RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000110647.7

Trp53bp1-201, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trp53bp1, Length 9,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Mier1Q5UAK0 511 aa8,41□□□□□ -1,06
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Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Cep164Q5DU05 1446 aa8,4□□□□□ -1,06
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Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP8,37□□□□□ -1,07
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Htatsf1Q8BGC0 757 aa8,37□□□□□ -1,07
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Calcoco2A2A6M5 331 aa8,35□□□□□ -1,07
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Abcc8B2RUS7 1588 aa8,35□□□□□ -1,07
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Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 MccE9PWI3 1003 aa8,34□□□□□ -1,07
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Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa8,32□□□□□ -1,08
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Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Mtus2Q3UHD3 1353 aa8,31□□□□□ -1,08
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP8,31□□□□□ -1,08
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Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Sh3bp5Q9Z131 463 aa8,25□□□□□ -1,09
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Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 A0A1L1SQF0 893 aa8,13□□□□□ -1,11
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Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP8,13□□□□□ -1,11
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Atp6v1dP57746 247 aa8,13□□□□□ -1,11
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP8,13□□□□□ -1,11
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Slc4a1apE9PX68 744 aa8,12□□□□□ -1,11
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Iffo2Q8R2V2 512 aa8,12□□□□□ -1,11
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Tpm2P58774 284 aa8,12□□□□□ -1,11
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