RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000110647.7

Trp53bp1-201, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trp53bp1, Length 9,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Rhox8Q6VSS7 320 aa11,07□□□□□ -0,64
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Cngb1E1AZ71 1325 aa10,4□□□□□ -0,75
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa10,38□□□□□ -0,75
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP10,37□□□□□ -0,75
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Wdr66E9Q743 1299 aa10,1□□□□□ -0,79
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP10,08□□□□□ -0,8
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ube2uB1AUC4 352 aa9,99□□□□□ -0,81
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP9,98□□□□□ -0,81
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Zeb1Q64318 1117 aa9,91□□□□□ -0,82
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Trim41Q5NCC3 630 aa9,81□□□□□ -0,84
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Stra8P70278 393 aa9,79□□□□□ -0,84
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Npm2Q80W85 207 aa9,79□□□□□ -0,84
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Rtl1Q7M732 1744 aa9,7□□□□□ -0,86
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa9,65□□□□□ -0,86
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP9,58□□□□□ -0,88
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa9,56□□□□□ -0,88
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Myt1lP97500 1187 aa9,47□□□□□ -0,89
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 NischQ80TM9 1593 aa9,46□□□□□ -0,9
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ccdc180J3QNE4 1664 aa9,45□□□□□ -0,9
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 NefmP08553 848 aa9,45□□□□□ -0,9
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Amer1Q7TS75 1132 aa9,44□□□□□ -0,9
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 CenpbP27790 599 aa9,4□□□□□ -0,91
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 NeflP08551 543 aa9,39□□□□□ -0,91
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Gab3Q8BSM5 595 aa9,38□□□□□ -0,91
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 NclP09405 707 aaKnown RBP9,35□□□□□ -0,91
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP9,32□□□□□ -0,92
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa9,31□□□□□ -0,92
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 NrdcQ8BHG1 1161 aa9,29□□□□□ -0,92
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Os9Q8K2C7 672 aa9,27□□□□□ -0,93
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Tnnt3Q9QZ47 272 aa9,22□□□□□ -0,93
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Myt1Q8CFC2 1127 aa9,16□□□□□ -0,94
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Gm13697A2AK42 830 aa9,14□□□□□ -0,95
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 UbtfP25976 765 aaKnown RBP9,14□□□□□ -0,95
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP9,11□□□□□ -0,95
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Slc24a1Q91WD8 1130 aa9,11□□□□□ -0,95
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Il27Q8K3I6 234 aa9,1□□□□□ -0,95
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Rtl5Q5DTT4 599 aa9,08□□□□□ -0,96
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 4933416C03RikQ3V063 378 aa9,07□□□□□ -0,96
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP9,06□□□□□ -0,96
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP9,02□□□□□ -0,96
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 HrcG5E8J6 738 aa9,02□□□□□ -0,96
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP9,01□□□□□ -0,97
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP8,98□□□□□ -0,97
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP8,97□□□□□ -0,97
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Gm13695A2AK44 830 aa8,96□□□□□ -0,97
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP8,96□□□□□ -0,97
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Neurod1Q60867 357 aa8,93□□□□□ -0,98
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Nlrp6Q91WS2 869 aa8,87□□□□□ -0,99
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP8,87□□□□□ -0,99
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Atp1b4Q99ME6 356 aa8,85□□□□□ -0,99
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 TonslQ6NZL6 1363 aa8,84□□□□□ -0,99
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa8,84□□□□□ -0,99
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Abcc9P70170 1546 aa8,82□□□□□ -1
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP8,82□□□□□ -1
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP8,8□□□□□ -1
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP8,78□□□□□ -1
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa8,78□□□□□ -1
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Zfp777B9EKF4 885 aa8,78□□□□□ -1
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ccer2J3QPU5 274 aa8,78□□□□□ -1
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Clstn2Q9ER65 966 aa8,77□□□□□ -1,01
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Znf326O88291 580 aa8,77□□□□□ -1,01
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP8,76□□□□□ -1,01
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Erich6D3Z6S9 713 aa8,74□□□□□ -1,01
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa8,74□□□□□ -1,01
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP8,73□□□□□ -1,01
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 CatipB9EKE5 520 aa8,68□□□□□ -1,02
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa8,66□□□□□ -1,02
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Chic1Q8CBW7 227 aa8,65□□□□□ -1,02
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa8,64□□□□□ -1,03
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Anp32aO35381 247 aa8,63□□□□□ -1,03
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP8,62□□□□□ -1,03
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP8,61□□□□□ -1,03
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Polr3glQ8R0C0 218 aa8,61□□□□□ -1,03
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 DaxxO35613 739 aa8,61□□□□□ -1,03
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP8,6□□□□□ -1,03
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 ClspnQ80YR7 1315 aa8,59□□□□□ -1,03
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Fgd1P52734 960 aa8,57□□□□□ -1,04
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP8,55□□□□□ -1,04
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Lmod2Q3UHZ5 550 aa8,55□□□□□ -1,04
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP8,55□□□□□ -1,04
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Dnai2A2AC93 623 aa8,53□□□□□ -1,04
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa8,53□□□□□ -1,04
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 IqubQ8CDK3 788 aa8,52□□□□□ -1,04
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Adam1bQ8R534 806 aa8,52□□□□□ -1,05
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 PnnO35691 725 aaKnown RBP8,51□□□□□ -1,05
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Plppr3Q7TPB0 716 aa8,51□□□□□ -1,05
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ercc6F8VPZ5 1481 aa8,5□□□□□ -1,05
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Iqcf3Q9D498 203 aa8,5□□□□□ -1,05
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Clip1Q922J3 1391 aa8,48□□□□□ -1,05
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ccdc18Q640L5 1455 aa8,48□□□□□ -1,05
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Ubl4bQ9CQ84 188 aa8,48□□□□□ -1,05
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Pde3bQ61409 1100 aa8,46□□□□□ -1,06
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 HdgfP51859 237 aaKnown RBP8,46□□□□□ -1,06
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 P3h3Q8CG70 732 aa8,45□□□□□ -1,06
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa8,44□□□□□ -1,06
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Trim44Q9QXA7 346 aa8,43□□□□□ -1,06
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP8,43□□□□□ -1,06
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa8,41□□□□□ -1,06
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Rsph4aQ8BYM7 716 aa8,41□□□□□ -1,06
Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 Pcgf6Q99NA9 353 aa8,41□□□□□ -1,06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,8 ms