RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064454.11

Gcn1l1-201, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gcn1l1, Length 8,555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Sall2Q9QX96 1004 aa15.2■□□□□ 0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 CanxP35564 591 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Trim30dE9PWL0 497 aa15.16■□□□□ 0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Mrs2Q5NCE8 434 aa15.15■□□□□ 0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Trim26Q99PN3 545 aa15.14■□□□□ 0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Dcaf1Q80TR8 1506 aa15.13■□□□□ 0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Clstn2Q9ER65 966 aa15.11■□□□□ 0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Htatsf1Q8BGC0 757 aa15.11■□□□□ 0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Adam1bQ8R534 806 aa15.1■□□□□ 0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 PnnO35691 725 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Plcb2A3KGF7 1181 aa15.05■□□□□ -0
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 P3h3Q8CG70 732 aa15.04■□□□□ -0
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Cep164Q5DU05 1446 aa15.04■□□□□ -0
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Chic2Q9D9G3 165 aa15.04■□□□□ -0
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Irx6Q9ER75 438 aa14.99□□□□□ -0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 BlmO88700 1416 aa14.99□□□□□ -0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ccdc27Q3V036 639 aa14.98□□□□□ -0.01
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Casc1Q6TDU8 730 aa14.95□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ofd1Q80Z25 1017 aa14.95□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Map7O88735 730 aa14.94□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 IqubQ8CDK3 788 aa14.94□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ppm1gQ61074 542 aa14.93□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Abcc8B2RUS7 1588 aa14.93□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Fam71e1A1L3C1 212 aa14.91□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rgl3Q3UYI5 709 aa14.9□□□□□ -0.02
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Tnnt2P50752 301 aa14.89□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Clstn1Q9EPL2 979 aa14.89□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa14.87□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Znf316Q6PGE4 1016 aa14.87□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa14.85□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Apbb1Q9QXJ1 710 aa14.85□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Calcoco2A2A6M5 331 aa14.83□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ubl4bQ9CQ84 188 aa14.82□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Gm6268A2A3U9 297 aa14.81□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 MccE9PWI3 1003 aa14.81□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Gm973E9Q295 1059 aa14.81□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Iqcf3Q9D498 203 aa14.8□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa14.8□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Kdm2aP59997 1161 aa14.8□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Zfp777B9EKF4 885 aa14.78□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Neurod2Q62414 383 aa14.78□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Erich6bQ9D4S6 220 aa14.78□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Sh3bp5Q9Z131 463 aa14.77□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 NudcO35685 332 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Card11Q8CIS0 1159 aa14.76□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Spryd3E9Q9B3 442 aa14.76□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Setd5Q5XJV7 1441 aa14.76□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Irx3P81067 507 aa14.74□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa14.74□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 AU015836B2RUM3 263 aa14.74□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Gm20521D3Z5F7 333 aa14.73□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Armcx1Q9CX83 456 aa14.72□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Dbr1Q923B1 550 aa14.72□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 MsnP26041 577 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Pcmtd1P59913 357 aa14.71□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa14.7□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Anapc15P60007 132 aa14.7□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa14.69□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Stag3O70576 1240 aa14.68□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 NgefQ8CHT1 710 aa14.67□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 B4galnt3Q6L8S8 986 aa14.67□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rassf8Q8CJ96 419 aa14.65□□□□□ -0.06
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa14.64□□□□□ -0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rwdd1Q9CQK7 243 aa14.63□□□□□ -0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Pde3bQ61409 1100 aa14.61□□□□□ -0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Bcl11aQ9QYE3 773 aa14.61□□□□□ -0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 RdxP26043 583 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Dnai2A2AC93 623 aa14.6□□□□□ -0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Mtus2Q3UHD3 1353 aa14.59□□□□□ -0.07
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Eea1Q8BL66 1411 aa14.58□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Fhad1A6PWD2 1420 aa14.56□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 R3hcc1Q8BSI6 488 aa14.55□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Dnai1Q8C0M8 701 aa14.55□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Iffo2Q8R2V2 512 aa14.55□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Stk24Q99KH8 431 aa14.54□□□□□ -0.08
Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 Ccdc18Q640L5 1455 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.5 ms