RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100497.10

Actb-201, Transcript of Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Actb, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Axon, Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Dendrite, Endoplasmic reticulum, Exosome, Growth cone, Lamellipodium, Perinuclear, Ribosome, Somatodendritic compartment .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actb-201ENSMUST00000100497 Rnf212bD3Z423 297 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 BokO35425 213 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Dlx4P70436 240 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 C1qtnf9Q4ZJN1 333 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Smim7Q5RKS2 75 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Hoxc12Q8K5B8 280 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr123Q8VFQ1 309 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1242Q8VGM6 306 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Ythdf2Q91YT7 579 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Ms4a6bQ99N09 244 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Q9D8L0 127 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Trbv1A0A0B4J1G7 116 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Igkv14-130A0A0G2JF45 117 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr218E9PWV2 313 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Vmn1r78K7N608 313 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Phxr2P15972 65 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1537P34983 314 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 1700009N14RikQ14AA6 216 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 KncnQ307W7 124 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr148Q60887 310 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Ubald1Q6P3B2 176 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Q9DAZ5 108 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Vmn1r46Q9EQ45 309 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Cst10Q9JM84 148 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Hsd17b6Q9R092 317 aa9.86□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv1-15A0A0A6YXA5 117 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1116E9PXB8 307 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr978E9Q985 311 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr624F8VQI7 308 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 TfpiO54819 306 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Lgals1P16045 135 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Cdkn1aP39689 159 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Plp1P60202 277 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Ube2l3P68037 154 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Gcm1P70348 436 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Pip4p1Q3TWL2 284 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Higd1cQ76I25 96 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Foxn4Q8K3Q3 521 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr509Q8VF20 321 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Dolpp1Q9JMF7 238 aa9.85□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm21060J3KMU4 56 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Edn1P22387 202 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Il3raP26952 396 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm10447Q3UQ92 135 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm10334Q792Y8 246 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1535Q7TQU0 326 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Elovl5Q8BHI7 299 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr211Q8VGH2 309 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 4933414I15RikQ9D4D5 133 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Foxj2Q9ES18 565 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv1-31A0A0A6YWK5 117 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm9970F6ZED4 185 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 P01788 123 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 P04944 107 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 HexbP20060 536 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Cd81P35762 236 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 KhkP97328 298 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Fam173aQ501J2 229 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 OstcQ78XF5 149 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr963Q7TRA9 311 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Tm2d1Q99MB3 208 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Pygo1Q9D0P5 417 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem239Q9DA47 151 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem183Q9JJB9 375 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Pf4Q9Z126 105 aa9.84□□□□□ -0.83
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Cldn34c4A2ANA3 212 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm5741B2RVA4 72 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr556E9Q549 324 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr748E9Q9Z0 307 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Rpp30O88796 268 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 P01724 129 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 LtaP09225 202 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr263Q7TQT8 317 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Tusc5Q8C838 173 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr984Q8VFN1 314 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Cyyr1Q8VIH7 165 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Sh3bgrl3Q91VW3 93 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Insig2Q91WG1 225 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Cldn16Q925N4 235 aa9.83□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 NbasE9Q411 2356 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv5-6A0A075B5Q0 117 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm11565A2A4M7 156 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1189A2AV11 306 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Amn1B8JKV0 258 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm21900J3QP38 180 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 P0C1Z5 52 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Znrf2Q71FD5 238 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 BC049730Q810N3 246 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Slc36a4Q8CH36 500 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Derl1Q99J56 251 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Gpa33Q9JKA5 319 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 D930048N14RikA2AA67 225 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 AsmtD3KU66 387 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Tnfsf11O35235 316 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Cnih1O35372 144 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Hoxa3P02831 443 aa9.82□□□□□ -0.84
Actb-201ENSMUST00000100497 Hes1P35428 282 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 75.1 ms