Protein–RNA interactions for Protein: P26952

Il3ra, Interleukin-3 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il3raP26952 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Il3raP26952 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Il3raP26952 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Il3raP26952 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Il3raP26952 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Il3raP26952 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Il3raP26952 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Il3raP26952 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Il3raP26952 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Il3raP26952 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Il3raP26952 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Il3raP26952 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Il3raP26952 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Il3raP26952 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Il3raP26952 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Il3raP26952 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Il3raP26952 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Il3raP26952 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Il3raP26952 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Il3raP26952 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il3raP26952 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il3raP26952 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il3raP26952 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il3raP26952 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il3raP26952 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Il3raP26952 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Il3raP26952 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Il3raP26952 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Il3raP26952 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Il3raP26952 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Il3raP26952 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Il3raP26952 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Il3raP26952 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Il3raP26952 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il3raP26952 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il3raP26952 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Il3raP26952 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Il3raP26952 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Il3raP26952 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Il3raP26952 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Il3raP26952 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Il3raP26952 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Il3raP26952 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Il3raP26952 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Il3raP26952 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Il3raP26952 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il3raP26952 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Il3raP26952 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Il3raP26952 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Il3raP26952 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il3raP26952 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il3raP26952 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il3raP26952 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Il3raP26952 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Il3raP26952 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Il3raP26952 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il3raP26952 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il3raP26952 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il3raP26952 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il3raP26952 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il3raP26952 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il3raP26952 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Il3raP26952 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Il3raP26952 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Il3raP26952 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Il3raP26952 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il3raP26952 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Il3raP26952 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Il3raP26952 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Il3raP26952 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Il3raP26952 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Il3raP26952 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il3raP26952 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il3raP26952 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Il3raP26952 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il3raP26952 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il3raP26952 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il3raP26952 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il3raP26952 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Il3raP26952 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Il3raP26952 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Il3raP26952 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Il3raP26952 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il3raP26952 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il3raP26952 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il3raP26952 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Il3raP26952 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Il3raP26952 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il3raP26952 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Il3raP26952 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Il3raP26952 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Il3raP26952 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Il3raP26952 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il3raP26952 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il3raP26952 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il3raP26952 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il3raP26952 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il3raP26952 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il3raP26952 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il3raP26952 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms