Protein–RNA interactions for Protein: P20060

Hexb, Beta-hexosaminidase subunit beta, mousemouse

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Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexbP20060 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HexbP20060 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HexbP20060 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HexbP20060 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HexbP20060 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HexbP20060 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HexbP20060 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HexbP20060 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HexbP20060 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HexbP20060 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HexbP20060 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HexbP20060 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HexbP20060 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HexbP20060 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HexbP20060 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HexbP20060 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HexbP20060 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HexbP20060 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HexbP20060 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HexbP20060 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HexbP20060 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HexbP20060 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HexbP20060 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HexbP20060 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HexbP20060 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HexbP20060 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HexbP20060 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HexbP20060 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HexbP20060 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HexbP20060 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HexbP20060 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HexbP20060 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HexbP20060 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HexbP20060 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HexbP20060 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HexbP20060 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HexbP20060 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HexbP20060 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HexbP20060 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HexbP20060 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HexbP20060 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HexbP20060 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HexbP20060 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexbP20060 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HexbP20060 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HexbP20060 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HexbP20060 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HexbP20060 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HexbP20060 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HexbP20060 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HexbP20060 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HexbP20060 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HexbP20060 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HexbP20060 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HexbP20060 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HexbP20060 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HexbP20060 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HexbP20060 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HexbP20060 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HexbP20060 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HexbP20060 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HexbP20060 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HexbP20060 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HexbP20060 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HexbP20060 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HexbP20060 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HexbP20060 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HexbP20060 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HexbP20060 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HexbP20060 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HexbP20060 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HexbP20060 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HexbP20060 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HexbP20060 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HexbP20060 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HexbP20060 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HexbP20060 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HexbP20060 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HexbP20060 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HexbP20060 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HexbP20060 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HexbP20060 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HexbP20060 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HexbP20060 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HexbP20060 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HexbP20060 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HexbP20060 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HexbP20060 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HexbP20060 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HexbP20060 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HexbP20060 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HexbP20060 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HexbP20060 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HexbP20060 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HexbP20060 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HexbP20060 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HexbP20060 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HexbP20060 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HexbP20060 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HexbP20060 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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