Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Pip4p1Q3TWL2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pip4p1Q3TWL2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pip4p1Q3TWL2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Pip4p1Q3TWL2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Pip4p1Q3TWL2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pip4p1Q3TWL2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pip4p1Q3TWL2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pip4p1Q3TWL2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Pip4p1Q3TWL2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pip4p1Q3TWL2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pip4p1Q3TWL2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pip4p1Q3TWL2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pip4p1Q3TWL2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pip4p1Q3TWL2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pip4p1Q3TWL2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pip4p1Q3TWL2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pip4p1Q3TWL2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pip4p1Q3TWL2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pip4p1Q3TWL2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pip4p1Q3TWL2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pip4p1Q3TWL2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pip4p1Q3TWL2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pip4p1Q3TWL2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pip4p1Q3TWL2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pip4p1Q3TWL2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pip4p1Q3TWL2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pip4p1Q3TWL2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pip4p1Q3TWL2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pip4p1Q3TWL2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pip4p1Q3TWL2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pip4p1Q3TWL2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pip4p1Q3TWL2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pip4p1Q3TWL2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pip4p1Q3TWL2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pip4p1Q3TWL2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pip4p1Q3TWL2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pip4p1Q3TWL2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pip4p1Q3TWL2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pip4p1Q3TWL2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pip4p1Q3TWL2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pip4p1Q3TWL2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Pip4p1Q3TWL2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pip4p1Q3TWL2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Pip4p1Q3TWL2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pip4p1Q3TWL2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pip4p1Q3TWL2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pip4p1Q3TWL2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pip4p1Q3TWL2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pip4p1Q3TWL2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pip4p1Q3TWL2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pip4p1Q3TWL2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pip4p1Q3TWL2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pip4p1Q3TWL2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4p1Q3TWL2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pip4p1Q3TWL2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pip4p1Q3TWL2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pip4p1Q3TWL2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pip4p1Q3TWL2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pip4p1Q3TWL2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pip4p1Q3TWL2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pip4p1Q3TWL2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pip4p1Q3TWL2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pip4p1Q3TWL2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pip4p1Q3TWL2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pip4p1Q3TWL2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pip4p1Q3TWL2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pip4p1Q3TWL2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pip4p1Q3TWL2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pip4p1Q3TWL2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pip4p1Q3TWL2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pip4p1Q3TWL2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pip4p1Q3TWL2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pip4p1Q3TWL2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pip4p1Q3TWL2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pip4p1Q3TWL2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pip4p1Q3TWL2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pip4p1Q3TWL2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pip4p1Q3TWL2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pip4p1Q3TWL2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pip4p1Q3TWL2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pip4p1Q3TWL2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pip4p1Q3TWL2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pip4p1Q3TWL2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pip4p1Q3TWL2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pip4p1Q3TWL2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pip4p1Q3TWL2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pip4p1Q3TWL2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pip4p1Q3TWL2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pip4p1Q3TWL2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4p1Q3TWL2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pip4p1Q3TWL2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pip4p1Q3TWL2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pip4p1Q3TWL2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pip4p1Q3TWL2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pip4p1Q3TWL2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pip4p1Q3TWL2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pip4p1Q3TWL2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pip4p1Q3TWL2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pip4p1Q3TWL2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms