Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
LtaP09225 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
LtaP09225 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
LtaP09225 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
LtaP09225 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
LtaP09225 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
LtaP09225 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
LtaP09225 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
LtaP09225 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
LtaP09225 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
LtaP09225 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
LtaP09225 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
LtaP09225 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
LtaP09225 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
LtaP09225 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
LtaP09225 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
LtaP09225 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
LtaP09225 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
LtaP09225 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
LtaP09225 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
LtaP09225 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
LtaP09225 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
LtaP09225 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,88■■□□□ 1,57
LtaP09225 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
LtaP09225 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
LtaP09225 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
LtaP09225 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
LtaP09225 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
LtaP09225 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
LtaP09225 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
LtaP09225 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
LtaP09225 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,42■■□□□ 1,5
LtaP09225 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,41■■□□□ 1,5
LtaP09225 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
LtaP09225 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
LtaP09225 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
LtaP09225 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
LtaP09225 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
LtaP09225 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
LtaP09225 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
LtaP09225 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,09■■□□□ 1,45
LtaP09225 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
LtaP09225 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
LtaP09225 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
LtaP09225 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
LtaP09225 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
LtaP09225 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
LtaP09225 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
LtaP09225 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
LtaP09225 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
LtaP09225 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
LtaP09225 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,67■■□□□ 1,38
LtaP09225 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
LtaP09225 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,66■■□□□ 1,38
LtaP09225 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
LtaP09225 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
LtaP09225 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,51■■□□□ 1,35
LtaP09225 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
LtaP09225 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
LtaP09225 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
LtaP09225 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
LtaP09225 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
LtaP09225 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
LtaP09225 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
LtaP09225 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
LtaP09225 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
LtaP09225 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
LtaP09225 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
LtaP09225 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
LtaP09225 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,3■■□□□ 1,32
LtaP09225 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
LtaP09225 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,27■■□□□ 1,32
LtaP09225 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
LtaP09225 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
LtaP09225 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
LtaP09225 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
LtaP09225 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
LtaP09225 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
LtaP09225 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
LtaP09225 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
LtaP09225 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
LtaP09225 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
LtaP09225 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
LtaP09225 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
LtaP09225 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
LtaP09225 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
LtaP09225 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
LtaP09225 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
LtaP09225 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,81■■□□□ 1,24
LtaP09225 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
LtaP09225 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,77■■□□□ 1,24
LtaP09225 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
LtaP09225 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,72■■□□□ 1,23
LtaP09225 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
LtaP09225 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
LtaP09225 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
LtaP09225 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
LtaP09225 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,63■■□□□ 1,21
LtaP09225 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
LtaP09225 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
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