Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Vmn1r46Q9EQ45 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vmn1r46Q9EQ45 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn1r46Q9EQ45 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r46Q9EQ45 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r46Q9EQ45 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r46Q9EQ45 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r46Q9EQ45 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r46Q9EQ45 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r46Q9EQ45 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r46Q9EQ45 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r46Q9EQ45 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r46Q9EQ45 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r46Q9EQ45 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r46Q9EQ45 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r46Q9EQ45 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r46Q9EQ45 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r46Q9EQ45 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r46Q9EQ45 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r46Q9EQ45 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r46Q9EQ45 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r46Q9EQ45 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r46Q9EQ45 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r46Q9EQ45 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r46Q9EQ45 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r46Q9EQ45 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r46Q9EQ45 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r46Q9EQ45 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r46Q9EQ45 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r46Q9EQ45 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r46Q9EQ45 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r46Q9EQ45 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r46Q9EQ45 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r46Q9EQ45 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r46Q9EQ45 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r46Q9EQ45 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r46Q9EQ45 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r46Q9EQ45 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r46Q9EQ45 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r46Q9EQ45 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r46Q9EQ45 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r46Q9EQ45 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r46Q9EQ45 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r46Q9EQ45 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r46Q9EQ45 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r46Q9EQ45 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r46Q9EQ45 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vmn1r46Q9EQ45 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r46Q9EQ45 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r46Q9EQ45 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r46Q9EQ45 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r46Q9EQ45 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r46Q9EQ45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r46Q9EQ45 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r46Q9EQ45 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r46Q9EQ45 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r46Q9EQ45 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r46Q9EQ45 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r46Q9EQ45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r46Q9EQ45 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r46Q9EQ45 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r46Q9EQ45 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r46Q9EQ45 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r46Q9EQ45 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r46Q9EQ45 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r46Q9EQ45 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r46Q9EQ45 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r46Q9EQ45 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r46Q9EQ45 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r46Q9EQ45 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r46Q9EQ45 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r46Q9EQ45 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r46Q9EQ45 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r46Q9EQ45 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r46Q9EQ45 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r46Q9EQ45 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r46Q9EQ45 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r46Q9EQ45 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r46Q9EQ45 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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