Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Dlx4P70436 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Dlx4P70436 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Dlx4P70436 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Dlx4P70436 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Dlx4P70436 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Dlx4P70436 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Dlx4P70436 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Dlx4P70436 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Dlx4P70436 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Dlx4P70436 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Dlx4P70436 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Dlx4P70436 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Dlx4P70436 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Dlx4P70436 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Dlx4P70436 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Dlx4P70436 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Dlx4P70436 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Dlx4P70436 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Dlx4P70436 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Dlx4P70436 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Dlx4P70436 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Dlx4P70436 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Dlx4P70436 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Dlx4P70436 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Dlx4P70436 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Dlx4P70436 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Dlx4P70436 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Dlx4P70436 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Dlx4P70436 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Dlx4P70436 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Dlx4P70436 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Dlx4P70436 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Dlx4P70436 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Dlx4P70436 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Dlx4P70436 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Dlx4P70436 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Dlx4P70436 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Dlx4P70436 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Dlx4P70436 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Dlx4P70436 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Dlx4P70436 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Dlx4P70436 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Dlx4P70436 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Dlx4P70436 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Dlx4P70436 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Dlx4P70436 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Dlx4P70436 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Dlx4P70436 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Dlx4P70436 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Dlx4P70436 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Dlx4P70436 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Dlx4P70436 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Dlx4P70436 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Dlx4P70436 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Dlx4P70436 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Dlx4P70436 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Dlx4P70436 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Dlx4P70436 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Dlx4P70436 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Dlx4P70436 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Dlx4P70436 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
Dlx4P70436 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Dlx4P70436 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Dlx4P70436 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Dlx4P70436 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Dlx4P70436 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Dlx4P70436 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Dlx4P70436 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Dlx4P70436 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Dlx4P70436 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Dlx4P70436 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
Dlx4P70436 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Dlx4P70436 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Dlx4P70436 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Dlx4P70436 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Dlx4P70436 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Dlx4P70436 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Dlx4P70436 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Dlx4P70436 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Dlx4P70436 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Dlx4P70436 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Dlx4P70436 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Dlx4P70436 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Dlx4P70436 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Dlx4P70436 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Dlx4P70436 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Dlx4P70436 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Dlx4P70436 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Dlx4P70436 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Dlx4P70436 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Dlx4P70436 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Dlx4P70436 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Dlx4P70436 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Dlx4P70436 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Dlx4P70436 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Dlx4P70436 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Dlx4P70436 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Dlx4P70436 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Dlx4P70436 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,64■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58,9 ms