Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Ms4a6bQ99N09 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ms4a6bQ99N09 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ms4a6bQ99N09 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ms4a6bQ99N09 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ms4a6bQ99N09 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ms4a6bQ99N09 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ms4a6bQ99N09 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ms4a6bQ99N09 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Ms4a6bQ99N09 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ms4a6bQ99N09 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,85■■□□□ 1,57
Ms4a6bQ99N09 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Ms4a6bQ99N09 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ms4a6bQ99N09 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Ms4a6bQ99N09 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
Ms4a6bQ99N09 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Ms4a6bQ99N09 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ms4a6bQ99N09 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
Ms4a6bQ99N09 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ms4a6bQ99N09 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ms4a6bQ99N09 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ms4a6bQ99N09 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ms4a6bQ99N09 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ms4a6bQ99N09 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ms4a6bQ99N09 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
Ms4a6bQ99N09 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Ms4a6bQ99N09 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ms4a6bQ99N09 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ms4a6bQ99N09 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Ms4a6bQ99N09 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ms4a6bQ99N09 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ms4a6bQ99N09 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ms4a6bQ99N09 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ms4a6bQ99N09 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ms4a6bQ99N09 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ms4a6bQ99N09 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ms4a6bQ99N09 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ms4a6bQ99N09 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ms4a6bQ99N09 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ms4a6bQ99N09 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ms4a6bQ99N09 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ms4a6bQ99N09 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ms4a6bQ99N09 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ms4a6bQ99N09 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ms4a6bQ99N09 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ms4a6bQ99N09 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
Ms4a6bQ99N09 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ms4a6bQ99N09 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ms4a6bQ99N09 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ms4a6bQ99N09 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ms4a6bQ99N09 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Ms4a6bQ99N09 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ms4a6bQ99N09 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ms4a6bQ99N09 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ms4a6bQ99N09 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ms4a6bQ99N09 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ms4a6bQ99N09 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ms4a6bQ99N09 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ms4a6bQ99N09 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
Ms4a6bQ99N09 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ms4a6bQ99N09 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ms4a6bQ99N09 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ms4a6bQ99N09 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ms4a6bQ99N09 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ms4a6bQ99N09 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Ms4a6bQ99N09 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Ms4a6bQ99N09 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ms4a6bQ99N09 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
Ms4a6bQ99N09 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ms4a6bQ99N09 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ms4a6bQ99N09 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ms4a6bQ99N09 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ms4a6bQ99N09 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ms4a6bQ99N09 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ms4a6bQ99N09 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ms4a6bQ99N09 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ms4a6bQ99N09 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ms4a6bQ99N09 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ms4a6bQ99N09 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Ms4a6bQ99N09 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,15■■□□□ 1,14
Ms4a6bQ99N09 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Ms4a6bQ99N09 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ms4a6bQ99N09 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Ms4a6bQ99N09 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Ms4a6bQ99N09 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Ms4a6bQ99N09 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ms4a6bQ99N09 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ms4a6bQ99N09 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ms4a6bQ99N09 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ms4a6bQ99N09 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Ms4a6bQ99N09 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,98■■□□□ 1,11
Ms4a6bQ99N09 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ms4a6bQ99N09 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ms4a6bQ99N09 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ms4a6bQ99N09 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ms4a6bQ99N09 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ms4a6bQ99N09 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ms4a6bQ99N09 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ms4a6bQ99N09 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ms4a6bQ99N09 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms