Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Hoxc12Q8K5B8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc12Q8K5B8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc12Q8K5B8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc12Q8K5B8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc12Q8K5B8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxc12Q8K5B8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc12Q8K5B8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxc12Q8K5B8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxc12Q8K5B8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc12Q8K5B8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc12Q8K5B8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxc12Q8K5B8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc12Q8K5B8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hoxc12Q8K5B8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc12Q8K5B8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxc12Q8K5B8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc12Q8K5B8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc12Q8K5B8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc12Q8K5B8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc12Q8K5B8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc12Q8K5B8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc12Q8K5B8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc12Q8K5B8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc12Q8K5B8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc12Q8K5B8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc12Q8K5B8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc12Q8K5B8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc12Q8K5B8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc12Q8K5B8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc12Q8K5B8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc12Q8K5B8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc12Q8K5B8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc12Q8K5B8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc12Q8K5B8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc12Q8K5B8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc12Q8K5B8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc12Q8K5B8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc12Q8K5B8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc12Q8K5B8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc12Q8K5B8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc12Q8K5B8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc12Q8K5B8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc12Q8K5B8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc12Q8K5B8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc12Q8K5B8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc12Q8K5B8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc12Q8K5B8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc12Q8K5B8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc12Q8K5B8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc12Q8K5B8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc12Q8K5B8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc12Q8K5B8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc12Q8K5B8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc12Q8K5B8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc12Q8K5B8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc12Q8K5B8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc12Q8K5B8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc12Q8K5B8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc12Q8K5B8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc12Q8K5B8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc12Q8K5B8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc12Q8K5B8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc12Q8K5B8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc12Q8K5B8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc12Q8K5B8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc12Q8K5B8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc12Q8K5B8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc12Q8K5B8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc12Q8K5B8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc12Q8K5B8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc12Q8K5B8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc12Q8K5B8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc12Q8K5B8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc12Q8K5B8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc12Q8K5B8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc12Q8K5B8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc12Q8K5B8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc12Q8K5B8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc12Q8K5B8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc12Q8K5B8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc12Q8K5B8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc12Q8K5B8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms