RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Znf260Q62513 407 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prr23a3Q9CWP9 254 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hcfc2Q9D968 241 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Crim1Q9JLL0 1037 aa12.74□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q8VE95 218 aa12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lypd8Q9D7S0 255 aa12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pgpep1lQ9CWB5 130 aa12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnase6Q9D244 153 aa12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Suclg1Q9WUM5 346 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Znf691Q3TDE8 283 aa12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q9D727 114 aa12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Iglc3P01845 104 aa12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cdcp2Q8BQH6 427 aa12.73□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr235E9Q9Z6 312 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prdm6Q3UZD5 596 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv1-7A0A075B5T7 117 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm12355A2A4X6 163 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Srsf3P84104 164 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pnrc2Q9CR73 140 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Colca2F8VPY8 239 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Reg1P43137 165 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smim6Q3U0I6 56 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 March11Q8CBH7 400 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 LctF8VPT3 1931 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AdipoqQ60994 247 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fmc1Q9CR13 113 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Malrd1A2AJX4 2123 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plp1P60202 277 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bsph1Q3UW26 133 aa12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mbnl2Q8C181 373 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cdx1P18111 268 aa12.71□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm11110Q3U4K9 109 aa12.71□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hyls1Q9CXX0 307 aa12.71□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf125Q9D9R0 233 aa12.71□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa12.71□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rchy1Q9CR50 261 aa12.71□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trav16nA0A075B634 117 aa12.71□□□□□ -0.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prss32E9Q409 334 aa12.71□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr223Q8VF69 319 aa12.71□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NdpP48744 131 aa12.71□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BmperQ8CJ69 685 aa12.71□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tanc1Q0VGY8 1856 aa12.71□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 P18526 117 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Folr2Q05685 251 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1323Q8VF35 309 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igkv9-123A0A140T8N8 117 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nkx2-8O70584 235 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1178Q7TR20 323 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mrpl36Q99N90 102 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tcrg-V4A0A0B4J1J8 138 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Shisal1Q0VBP7 198 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 2200002J24RikQ9D807 110 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmem126aQ9D8Y1 196 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Iah1Q9DB29 249 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfpl1Q9DB43 310 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 V1ra8Q9EQ48 279 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HilpdaQ9JLS0 64 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trbv19A0A0B4J1H4 117 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 P04212 136 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trbv12-1A0A0B4J1H0 124 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 A0A1L1SR50 188 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lime1Q9EQR5 269 aa12.7□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6430628N08RikA0A0U1RQ45 177 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Psg18B2RSG7 476 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmem91Q8C581 172 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccl6P27784 116 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ripply2Q2WG76 128 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Olfr1380Q7TQT5 311 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TbpP29037 316 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GchfrP99025 84 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp72Q0VFY0 435 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zic3Q62521 466 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sh3bgrl3Q91VW3 93 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tmem29A2ANF5 204 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Thy1P01831 162 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Msrb2Q78J03 175 aa12.69□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trav6d-5A0A075B6B9 112 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tnfsf11O35235 316 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tm2d3Q8BJ83 261 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cox19Q8K0C8 92 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vopp1Q8R1C3 172 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chd3B1AR17 2055 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 1700084M14RikB1AT01 78 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cpsf4lE9Q2N0 280 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gstp2P46425 210 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hapln4Q80WM4 400 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cbln3Q9JHG0 197 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 F8Q06194 2319 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trav7n-5A0A075B604 112 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ChtopQ9CY57 249 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm20825J3QM67 227 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ssty2Q149W4 227 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cops9Q3U898 57 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Immp2lQ8BPT6 175 aa12.68□□□□□ -0.38
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dph3Q8K0W9 82 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.7 ms